RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-208ENST00000462602 EXOC6Q8TAG9 804 aa11.81□□□□□ -0.52
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SH3BP4-208ENST00000462602 NYXQ9GZU5 481 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-208ENST00000462602 USP44Q9H0E7 712 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-208ENST00000462602 UTYO14607 1347 aa11.81□□□□□ -0.52
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SH3BP4-208ENST00000462602 SUSD4Q5VX71 490 aa11.8□□□□□ -0.52
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SH3BP4-208ENST00000462602 SCN7AQ01118 1682 aa11.8□□□□□ -0.52
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SH3BP4-208ENST00000462602 QSER1Q2KHR3 1735 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP4-208ENST00000462602 CARMIL3Q8ND23 1372 aa11.79□□□□□ -0.52
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SH3BP4-208ENST00000462602 SH3TC1Q8TE82 1336 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-208ENST00000462602 NPHP1O15259 732 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-208ENST00000462602 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-208ENST00000462602 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-208ENST00000462602 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-208ENST00000462602 CDHR2Q9BYE9 1310 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-208ENST00000462602 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM177BA6PVY3 158 aa11.77□□□□□ -0.53
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SH3BP4-208ENST00000462602 NTSR2O95665 410 aa11.77□□□□□ -0.53
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SH3BP4-208ENST00000462602 MMP10P09238 476 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM89AQ96GI7 184 aa11.77□□□□□ -0.53
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SH3BP4-208ENST00000462602 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 CASP7P55210 303 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 MSL1Q68DK7 614 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 CNBD1Q8NA66 436 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 SUCLG2Q96I99 432 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 PLA2G12BQ9BX93 195 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 MTFR1LQ9H019 292 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 ST5P78524 1137 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 DDR1Q08345 913 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC10A5Q5PT55 438 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
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SH3BP4-208ENST00000462602 POLD1P28340 1107 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 ERFEQ4G0M1 354 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR5LQ6MZQ0 368 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 C1orf115Q9H7X2 142 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 HMMRO75330 724 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 ZBTB7AO95365 584 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP8B2P98198 1209 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 CEP85Q6P2H3 762 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 SYNE4Q8N205 404 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD44Q8N8A2 993 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 NLRP3Q96P20 1036 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 COL24A1Q17RW2 1714 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 CTSWP56202 376 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 FOXO4P98177 505 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 MTX1Q13505 466 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 LMBR1LQ6UX01 489 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 KAZALD1Q96I82 304 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 SRGAP3O43295 1099 aa11.71□□□□□ -0.53
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SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC152Q4G0S7 254 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 EPHA10Q5JZY3 1008 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 BRIP1Q9BX63 1249 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 CHMP3Q9Y3E7 222 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 RIC1Q4ADV7 1423 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCC12Q96J65 1359 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-208ENST00000462602 CASZ1Q86V15 1759 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-208ENST00000462602 PDE6BP35913 854 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-208ENST00000462602 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-208ENST00000462602 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC57Q2TAC2 916 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-208ENST00000462602 TTLL11Q8NHH1 800 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC136Q96JN2 1154 aa11.7□□□□□ -0.54
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