RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.72■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 ABCC4O15439 1325 aa24.72■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.71■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 ALDH1L1O75891 902 aa24.71■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 PTGER2P43116 358 aa24.71■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.71■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 NYXQ9GZU5 481 aa24.71■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.7■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 NTSR2O95665 410 aa24.69■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 GCKRQ14397 625 aa24.69■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 CNBD1Q8NA66 436 aa24.69■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 PANK1Q8TE04 598 aa24.69■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 RLBP1P12271 317 aa24.68■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.68■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.68■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.68■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.68■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 FAM89AQ96GI7 184 aa24.67■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 NEFLP07196 543 aa24.66■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 ST5P78524 1137 aa24.66■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 ERFEQ4G0M1 354 aa24.66■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.66■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.66■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.65■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 SYNE4Q8N205 404 aa24.65■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.64■■□□□ 1.54
SNHG12-201ENST00000461448 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.64■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 H7C1W4 665 aa24.63■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 GRM8O00222 908 aa24.63■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 KLHL34Q8N239 644 aa24.63■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.63■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 COG6Q9Y2V7 657 aa24.62■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 USP44Q9H0E7 712 aa24.61■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 ABCC12Q96J65 1359 aa24.6■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.6■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.59■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.59■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.59■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.58■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 CASP7P55210 303 aa24.58■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 MEIS3Q99687 375 aa24.58■■□□□ 1.53
SNHG12-201ENST00000461448 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.57■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 UTYO14607 1347 aa24.57■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 GNAI3P08754 354 aa24.57■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 AAMPQ13685 434 aa24.57■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 NLRP3Q96P20 1036 aa24.57■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 PDE6BP35913 854 aa24.56■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 PDE8AO60658 829 aa24.55■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 CRBNQ96SW2 442 aa24.55■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 SUCLG2Q96I99 432 aa24.54■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.54■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.53■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.53■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.52■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.52■■□□□ 1.52
SNHG12-201ENST00000461448 H0YIN7 160 aa24.51■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 CHRNA5P30532 468 aa24.5■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 CTSWP56202 376 aa24.5■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.5■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 A0A0G2JLW4 131 aa24.5■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 GNAI2P04899 355 aa24.5■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 TGFB2P61812 414 aa24.5■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 FOXO4P98177 505 aa24.5■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 KAZALD1Q96I82 304 aa24.5■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.5■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 LRP5O75197 1615 aa24.5■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.49■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 DPEP1P16444 411 aa24.49■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SNHG12-201ENST00000461448 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.49■■□□□ 1.51
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