RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 RGPD5Q99666 1765 aa24.57■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 NECTIN1Q15223 517 aa24.57■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.57■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.56■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.56■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.56■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 PDLIM2Q96JY6 352 aa24.56■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 FSD1Q9BTV5 496 aa24.56■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.56■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.56■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.56■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.56■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 DTNBO60941 627 aa24.55■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 ATF3P18847 181 aa24.55■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.55■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 KCNB2Q92953 911 aa24.55■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 TSPY26PQ9H489 355 aa24.55■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 USP16Q9Y5T5 823 aa24.55■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 KIF1AQ12756 1690 aa24.55■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.54■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.54■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 MEGF6O75095 1541 aa24.54■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 PHF14O94880 888 aa24.54■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 GJB2P29033 226 aa24.54■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 F13A1P00488 732 aa24.53■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 MAP4K1Q92918 833 aa24.53■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 A0A0D9SFI3 127 aa24.53■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 TMEM87AQ8NBN3 555 aa24.53■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 MST1RQ04912 1400 aa24.53■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 CHRNA2Q15822 529 aa24.52■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 HS1BP3Q53T59 392 aa24.52■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.52■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 C5P01031 1676 aa24.51■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 DCAF5Q96JK2 942 aa24.51■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 ME3Q16798 604 aa24.51■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 SLC27A2O14975 620 aa24.5■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 FIBPO43427 364 aa24.5■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 CYP27B1O15528 508 aa24.5■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 NECAB1Q8N987 351 aa24.5■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.5■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 ALS2Q96Q42 1657 aa24.49■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.49■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 PSMA5P28066 241 aa24.49■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.49■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 RNF20Q5VTR2 975 aa24.48■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 TPCN1Q9ULQ1 816 aa24.48■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.47■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 UBE2HP62256 183 aa24.47■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 ST3GAL1Q11201 340 aa24.47■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 COPRSQ9NQ92 184 aa24.47■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 SNRKQ9NRH2 765 aa24.47■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 MTMR6Q9Y217 621 aa24.47■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.47■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 CCDC183Q5T5S1 534 aa24.47■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 CABP4P57796 275 aa24.46■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 TMEM94Q12767 1356 aa24.46■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 TFCP2Q12800 502 aa24.46■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.46■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.45■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
IMP4-208ENST00000460766 MED23Q9ULK4 1368 aa24.45■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 A0A087WZG4 1122 aa24.45■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 TNNI3KQ59H18 835 aa24.45■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.45■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.44■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 MRC1P22897 1456 aa24.44■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.43■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 ATP5JP18859 108 aa24.43■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.43■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.42■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 RPS6KB1P23443 525 aa24.42■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD1Q15327 319 aa24.42■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 TCHHQ07283 1943 aa24.41■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 TAF5LO75529 589 aa24.4■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.4■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.4■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.4■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.4■■□□□ 1.5
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