RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 LRP10Q7Z4F1 713 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 SYNE4Q8N205 404 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 JMYQ8N9B5 988 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 BABAM1Q9NWV8 329 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 NTSR2O95665 410 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 IARSP41252 1262 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
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SH3BP4-206ENST00000446904 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
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SH3BP4-206ENST00000446904 KRT24Q2M2I5 525 aa13.49□□□□□ -0.25
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SH3BP4-206ENST00000446904 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa13.48□□□□□ -0.25
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SH3BP4-206ENST00000446904 FZD9O00144 591 aa13.47□□□□□ -0.25
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SH3BP4-206ENST00000446904 JDP2Q8WYK2 163 aa13.47□□□□□ -0.25
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SH3BP4-206ENST00000446904 PSMD1Q99460 953 aa13.47□□□□□ -0.25
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SH3BP4-206ENST00000446904 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC10A5Q5PT55 438 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 NLRP10Q86W26 655 aa13.46□□□□□ -0.25
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SH3BP4-206ENST00000446904 NLRP3Q96P20 1036 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP13.46□□□□□ -0.25
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SH3BP4-206ENST00000446904 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
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SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF428Q96B54 188 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 CHPF2Q9P2E5 772 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 GJA3Q9Y6H8 435 aa13.45□□□□□ -0.26
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SH3BP4-206ENST00000446904 GPC2Q8N158 579 aa13.44□□□□□ -0.26
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SH3BP4-206ENST00000446904 CREBZFQ9NS37 354 aa13.44□□□□□ -0.26
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SH3BP4-206ENST00000446904 CLEC11AQ9Y240 323 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 COL4A5P29400 1685 aa13.44□□□□□ -0.26
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SH3BP4-206ENST00000446904 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 ABCC4O15439 1325 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 PASKQ96RG2 1323 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 CFAP44Q96MT7 982 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 SH3TC1Q8TE82 1336 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 SCN4AP35499 1836 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 PPIP5K2O43314 1243 aa13.41□□□□□ -0.26
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SH3BP4-206ENST00000446904 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
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SH3BP4-206ENST00000446904 MBIPQ9NS73 344 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 APAF1O14727 1248 aa13.4□□□□□ -0.26
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SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa13.4□□□□□ -0.26
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SH3BP4-206ENST00000446904 CNTROBQ8N137 903 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 PLBD2Q8NHP8 589 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM88BA6NKF7 163 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 EPS15P42566 896 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 SCNN1DP51172 638 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 SP8Q8IXZ3 490 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 HYPKQ9NX55 129 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 CNTNAP1P78357 1384 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF853P0CG23 659 aa13.38□□□□□ -0.27
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