RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428361.5

CTDSP1-202, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 842 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-202ENST00000428361 NLRP3Q96P20 1036 aa20.14■□□□□ 0.81
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CTDSP1-202ENST00000428361 NTSR2O95665 410 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDSP1-202ENST00000428361 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDSP1-202ENST00000428361 CFAP44Q96MT7 982 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDSP1-202ENST00000428361 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDSP1-202ENST00000428361 PSMD1Q99460 953 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDSP1-202ENST00000428361 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.13■□□□□ 0.81
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CTDSP1-202ENST00000428361 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.11■□□□□ 0.81
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CTDSP1-202ENST00000428361 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
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CTDSP1-202ENST00000428361 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.06■□□□□ 0.8
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CTDSP1-202ENST00000428361 NLRP10Q86W26 655 aa20.06■□□□□ 0.8
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CTDSP1-202ENST00000428361 VPS33BQ9H267 617 aa20.05■□□□□ 0.8
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CTDSP1-202ENST00000428361 KRT24Q2M2I5 525 aa20.04■□□□□ 0.8
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CTDSP1-202ENST00000428361 TMC4Q7Z404 712 aa20.04■□□□□ 0.8
CTDSP1-202ENST00000428361 GPC2Q8N158 579 aa20.04■□□□□ 0.8
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CTDSP1-202ENST00000428361 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.03■□□□□ 0.8
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CTDSP1-202ENST00000428361 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.02■□□□□ 0.79
CTDSP1-202ENST00000428361 GOLGA2Q08379 1002 aa20.01■□□□□ 0.79
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CTDSP1-202ENST00000428361 C3orf67Q6ZVT6 689 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDSP1-202ENST00000428361 SP8Q8IXZ3 490 aa19.99■□□□□ 0.79
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CTDSP1-202ENST00000428361 CREBZFQ9NS37 354 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDSP1-202ENST00000428361 CCDC30Q5VVM6 783 aa19.97■□□□□ 0.79
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CTDSP1-202ENST00000428361 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CTDSP1-202ENST00000428361 GJA3Q9Y6H8 435 aa19.96■□□□□ 0.79
CTDSP1-202ENST00000428361 ANP32CO43423 234 aa19.95■□□□□ 0.78
CTDSP1-202ENST00000428361 LAMB2P55268 1798 aa19.94■□□□□ 0.78
CTDSP1-202ENST00000428361 POTEIP0CG38 1075 aa19.94■□□□□ 0.78
CTDSP1-202ENST00000428361 POTEJP0CG39 1038 aa19.94■□□□□ 0.78
CTDSP1-202ENST00000428361 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
CTDSP1-202ENST00000428361 IFFO2Q5TF58 517 aa19.94■□□□□ 0.78
CTDSP1-202ENST00000428361 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa19.93■□□□□ 0.78
CTDSP1-202ENST00000428361 AOC3Q16853 763 aa19.93■□□□□ 0.78
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