RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STK31Q9BXU1 1019 aa32.15■■■□□ 2.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa32.14■■■□□ 2.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 G2E3Q7L622 706 aa32.14■■■□□ 2.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RIC3Q7Z5B4 369 aa32.14■■■□□ 2.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RIC1Q4ADV7 1423 aa32.14■■■□□ 2.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC4A2P04920 1241 aa32.13■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CRY2Q49AN0 593 aa32.13■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C3orf67Q6ZVT6 689 aa32.13■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYNE4Q8N205 404 aa32.13■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NPR1P16066 1061 aa32.12■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CNKSR1Q969H4 720 aa32.12■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa32.12■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC10A5Q5PT55 438 aa32.11■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF123Q5XPI4 1314 aa32.09■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 E9PSI1 815 aa32.09■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLFN5Q08AF3 891 aa32.09■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDCA7LQ96GN5 454 aa32.09■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C21orf2O43822 256 aa32.08■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDX58O95786 925 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADCY9O60503 1353 aa32.07■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLX4Q8IY92 1834 aa32.07■■■□□ 2.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KSR2Q6VAB6 950 aa32.07■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYD88Q99836 296 aa32.07■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa32.07■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PI4KAP2A4QPH2 592 aa32.06■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa32.06■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C7orf43Q8WVR3 580 aa32.06■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SH3TC1Q8TE82 1336 aa32.05■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RASSF7Q02833 373 aa32.05■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRELPP51888 382 aa32.04■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FLIIQ13045 1269 aa32.04■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM89AQ96GI7 184 aa32.04■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NLRP3Q96P20 1036 aa32.04■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NFKBIEO00221 500 aa32.03■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ALDH1B1P30837 517 aa32.02■■■□□ 2.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C9orf131Q5VYM1 1079 aa32.01■■■□□ 2.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGKV5-2P06315 115 aa32■■■□□ 2.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OLFM4Q6UX06 510 aa32■■■□□ 2.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CACNA1SQ13698 1873 aa31.99■■■□□ 2.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC191Q8NCU4 936 aa31.99■■■□□ 2.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CRAMP1Q96RY5 1269 aa31.98■■■□□ 2.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF181Q9P0P0 153 aa31.96■■■□□ 2.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC51AQ86UW1 340 aa31.95■■■□□ 2.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SOGA3Q5TF21 947 aa31.94■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LAMB2P55268 1798 aa31.94■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SBF1O95248 1867 aa31.93■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa31.93■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LMNB1P20700 586 aa31.93■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DNAAF4Q8WXU2 420 aa31.93■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCC4O15439 1325 aa31.93■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CACNA1FO60840 1977 aa31.92■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEURL1BA8MQ27 555 aa31.92■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEXNQ0ZGT2 675 aa31.92■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC93Q567U6 631 aa31.92■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LTBP3Q9NS15 1303 aa31.92■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SNED1Q8TER0 1413 aa31.92■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAOK3Q9H2K8 898 aa31.91■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 F6X3S4 739 aa31.9■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP31.88■■■□□ 2.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SSH1Q8WYL5 1049 aa31.88■■■□□ 2.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RTKN2Q8IZC4 609 aa31.87■■■□□ 2.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINS1Q8NG48 757 aa31.86■■■□□ 2.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP31.85■■■□□ 2.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GCKRQ14397 625 aa31.85■■■□□ 2.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDHR2Q9BYE9 1310 aa31.84■■■□□ 2.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H7C1W4 665 aa31.84■■■□□ 2.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRAPQ13588 217 aa31.84■■■□□ 2.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BEND3Q5T5X7 828 aa31.84■■■□□ 2.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa31.84■■■□□ 2.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL4A1P02462 1669 aa31.83■■■□□ 2.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BBOX1O75936 387 aa31.83■■■□□ 2.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BCL2L13Q9BXK5 485 aa31.83■■■□□ 2.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa31.83■■■□□ 2.69
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