RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 CNNM1Q9NRU3 951 aa8.26□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 CALML3P27482 149 aa8.26□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 FLIIQ13045 1269 aa8.26□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 IDI1Q13907 227 aa8.26□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 IQCA1Q86XH1 822 aa8.26□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 LINS1Q8NG48 757 aa8.26□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 EFCAB6Q5THR3 1501 aa8.26□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 TRIM27P14373 513 aa8.26□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 CAVIN4Q5BKX8 364 aa8.26□□□□□ -1.09
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ALMS1-201ENST00000423048 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 PLVAPQ9BX97 442 aa8.26□□□□□ -1.09
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ALMS1-201ENST00000423048 BCAR3O75815 825 aa8.25□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa8.25□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
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ALMS1-201ENST00000423048 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.25□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 SOX12O15370 315 aa8.25□□□□□ -1.09
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ALMS1-201ENST00000423048 SERPINC1P01008 464 aa8.25□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.25□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 CTR9Q6PD62 1173 aa8.25□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 NEUROD6Q96NK8 337 aa8.25□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 FEZ1Q99689 392 aa8.25□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 KSR2Q6VAB6 950 aa8.25□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 ATP10DQ9P241 1426 aa8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 KIAA0754O94854 1291 aa8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 YEATS4O95619 227 aa8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 USP5P45974 858 aa8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 CETN1Q12798 172 aa8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 NCOA7Q8NI08 942 aa8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 TAF4BQ92750 862 aa8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 RGS12O14924 1447 aa8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 BAG4O95429 457 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
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ALMS1-201ENST00000423048 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 NF2P35240 595 aa8.24□□□□□ -1.09
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ALMS1-201ENST00000423048 ODF2Q5BJF6 829 aa8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 ALS2CR12Q96Q35 445 aa8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 NYXQ9GZU5 481 aa8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa8.24□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 STX6O43752 255 aa8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 PTPN14Q15678 1187 aa8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 BAG3O95817 575 aa8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 UBXN4Q92575 508 aa8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 GPR108Q9NPR9 543 aa8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 SPA17Q15506 151 aa8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 CEP112Q8N8E3 955 aa8.23□□□□□ -1.09
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ALMS1-201ENST00000423048 TMOD2Q9NZR1 351 aa8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 B4DLN1 442 aa8.23□□□□□ -1.09
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ALMS1-201ENST00000423048 ZNF445P59923 1031 aa8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
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ALMS1-201ENST00000423048 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 TSGA10Q9BZW7 698 aa8.23□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 PES1O00541 588 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 PDE6BP35913 854 aa8.22□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 PARP10Q53GL7 1025 aa8.22□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa8.22□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.22□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 MTA3Q9BTC8 594 aa8.22□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 PDE4BQ07343 736 aa8.22□□□□□ -1.09
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