RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415100.5

NIPSNAP1-202, Transcript of nipsnap homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene NIPSNAP1, Length 661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
NIPSNAP1-202ENST00000415100 VEGFBP49765 207 aa29.09■■■□□ 2.25
NIPSNAP1-202ENST00000415100 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
NIPSNAP1-202ENST00000415100 C8orf58Q8NAV2 365 aa29.09■■■□□ 2.25
NIPSNAP1-202ENST00000415100 C7orf43Q8WVR3 580 aa29.09■■■□□ 2.25
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CAMTA2O94983 1202 aa29.08■■■□□ 2.25
NIPSNAP1-202ENST00000415100 MASTLQ96GX5 879 aa29.08■■■□□ 2.25
NIPSNAP1-202ENST00000415100 SETDB2Q96T68 719 aa29.08■■■□□ 2.25
NIPSNAP1-202ENST00000415100 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa29.07■■■□□ 2.24
NIPSNAP1-202ENST00000415100 HOXB7P09629 217 aa29.07■■■□□ 2.24
NIPSNAP1-202ENST00000415100 WBP1LQ9NX94 342 aa29.07■■■□□ 2.24
NIPSNAP1-202ENST00000415100 TMEM88BA6NKF7 163 aa29.06■■■□□ 2.24
NIPSNAP1-202ENST00000415100 TSPYL6Q8N831 410 aa29.06■■■□□ 2.24
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ST5P78524 1137 aa29.05■■■□□ 2.24
NIPSNAP1-202ENST00000415100 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
NIPSNAP1-202ENST00000415100 AIDAQ96BJ3 306 aa29.05■■■□□ 2.24
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
NIPSNAP1-202ENST00000415100 USP16Q9Y5T5 823 aa29.04■■■□□ 2.24
NIPSNAP1-202ENST00000415100 A1BGP04217 495 aa29.02■■■□□ 2.24
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ZNF541Q9H0D2 1346 aa29.01■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 SLC34A2O95436 690 aa29.01■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CCDC93Q567U6 631 aa29.01■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 RASSF10A6NK89 507 aa29■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 LBX1P52954 281 aa29■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 NPHP1O15259 732 aa28.99■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 VAMP4O75379 141 aa28.99■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.99■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.99■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.98■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 HACL1Q9UJ83 578 aa28.98■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 NPR1P16066 1061 aa28.97■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 EPHX2P34913 555 aa28.96■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.96■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 NECTIN2Q92692 538 aa28.96■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CACNA1FO60840 1977 aa28.95■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-202ENST00000415100 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ERBB4Q15303 1308 aa28.94■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.94■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 FZD9O00144 591 aa28.93■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 DEFB115Q30KQ5 88 aa28.93■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CNTROBQ8N137 903 aa28.93■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ABHD8Q96I13 439 aa28.93■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 THSD7BQ9C0I4 1608 aa28.93■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 SNED1Q8TER0 1413 aa28.93■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 OLFM4Q6UX06 510 aa28.92■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ZNF428Q96B54 188 aa28.92■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.92■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 RTKN2Q8IZC4 609 aa28.91■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CHPF2Q9P2E5 772 aa28.91■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CLEC11AQ9Y240 323 aa28.91■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 RGL2O15211 777 aa28.9■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 NBPF26B4DH59 902 aa28.89■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 GPC2Q8N158 579 aa28.89■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 NBPF15Q8N660 670 aa28.89■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 STK31Q9BXU1 1019 aa28.89■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.89■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 IARSP41252 1262 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 PDIA6Q15084 440 aa28.88■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 PROSER3Q2NL68 480 aa28.87■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.87■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 MYL6BP14649 208 aa28.86■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 FAM161AQ3B820 660 aa28.86■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ANXA1P04083 346 aa28.85■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 SYNE4Q8N205 404 aa28.85■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 LTBP1Q14766 1721 aa28.85■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 COL4A5P29400 1685 aa28.84■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.84■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 PSMD1Q99460 953 aa28.84■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 HYPKQ9NX55 129 aa28.84■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 SLC4A2P04920 1241 aa28.83■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ALDH1B1P30837 517 aa28.83■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.83■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.83■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.83■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.81■■■□□ 2.2
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CRY2Q49AN0 593 aa28.8■■■□□ 2.2
NIPSNAP1-202ENST00000415100 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.8■■■□□ 2.2
NIPSNAP1-202ENST00000415100 RGS19P49795 217 aa28.79■■■□□ 2.2
NIPSNAP1-202ENST00000415100 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
NIPSNAP1-202ENST00000415100 JDP2Q8WYK2 163 aa28.78■■■□□ 2.2
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