RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402237.1

RPSAP43-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 43, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP43, Length 625 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP43-201ENST00000402237 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.26■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 COL4A5P29400 1685 aa22.26■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 GPC2Q8N158 579 aa22.25■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 ERBB4Q15303 1308 aa22.25■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.25■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 NTSR2O95665 410 aa22.24■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.24■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.24■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.23■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 CAPN15O75808 1086 aa22.23■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 PDIA6Q15084 440 aa22.23■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 JDP2Q8WYK2 163 aa22.23■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.23■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.23■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.22■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 SLC51AQ86UW1 340 aa22.22■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.21■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.21■■□□□ 1.15
RPSAP43-201ENST00000402237 LTBP1Q14766 1721 aa22.2■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 VEGFBP49765 207 aa22.2■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.2■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 CNTROBQ8N137 903 aa22.2■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 RIPK4P57078 832 aa22.19■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 PARP10Q53GL7 1025 aa22.19■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 FOXN1O15353 648 aa22.18■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 PROSER3Q2NL68 480 aa22.18■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.18■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.18■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.18■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.17■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 NLRP3Q96P20 1036 aa22.17■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 ANXA1P04083 346 aa22.16■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 SCNN1DP51172 638 aa22.16■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.16■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 LAMB2P55268 1798 aa22.15■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 RASSF10A6NK89 507 aa22.15■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 EPS15P42566 896 aa22.15■■□□□ 1.14
RPSAP43-201ENST00000402237 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.14■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 RALBP1Q15311 655 aa22.13■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.13■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 VPS33BQ9H267 617 aa22.13■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.13■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 WBP1LQ9NX94 342 aa22.13■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 ABCC4O15439 1325 aa22.12■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 COPS6Q7L5N1 327 aa22.12■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 NIM1KQ8IY84 436 aa22.12■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 PPIP5K2O43314 1243 aa22.11■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 AOC3Q16853 763 aa22.11■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 NLRP10Q86W26 655 aa22.11■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.1■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.1■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.1■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 NECTIN2Q92692 538 aa22.1■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.09■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 BBOX1O75936 387 aa22.09■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 TCIRG1Q13488 830 aa22.09■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 SP8Q8IXZ3 490 aa22.09■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 AIDAQ96BJ3 306 aa22.09■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 CHL1O00533 1208 aa22.08■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.08■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 TAF1P21675 1872 aa22.08■■□□□ 1.13
RPSAP43-201ENST00000402237 CXCL9Q07325 125 aa22.07■■□□□ 1.12
RPSAP43-201ENST00000402237 KRT24Q2M2I5 525 aa22.07■■□□□ 1.12
RPSAP43-201ENST00000402237 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.07■■□□□ 1.12
RPSAP43-201ENST00000402237 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.07■■□□□ 1.12
RPSAP43-201ENST00000402237 NEUROD2Q15784 382 aa22.06■■□□□ 1.12
RPSAP43-201ENST00000402237 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RPSAP43-201ENST00000402237 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RPSAP43-201ENST00000402237 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.06■■□□□ 1.12
RPSAP43-201ENST00000402237 CST9Q5W186 159 aa22.05■■□□□ 1.12
RPSAP43-201ENST00000402237 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.05■■□□□ 1.12
RPSAP43-201ENST00000402237 MPNDQ8N594 471 aa22.05■■□□□ 1.12
RPSAP43-201ENST00000402237 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RPSAP43-201ENST00000402237 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.05■■□□□ 1.12
RPSAP43-201ENST00000402237 TRAF5O00463 557 aa22.04■■□□□ 1.12
RPSAP43-201ENST00000402237 LBX1P52954 281 aa22.04■■□□□ 1.12
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