RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 ALDH1B1P30837 517 aa26.64■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 SOGA3Q5TF21 947 aa26.64■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.64■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.64■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.64■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 NLRP10Q86W26 655 aa26.63■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 TSPYL6Q8N831 410 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.6■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.6■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR63Q8IWG1 891 aa26.6■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.59■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF3CO14782 793 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 NLRP3Q96P20 1036 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC93Q567U6 631 aa26.57■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.56■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.55■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLGA2Q08379 1002 aa26.55■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.55■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.55■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 SYNE4Q8N205 404 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.53■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 OLFM4Q6UX06 510 aa26.53■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 LAMB2P55268 1798 aa26.52■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.52■■□□□ 1.84
UBE2E3-201ENST00000392415 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 GLTPD2A6NH11 291 aa26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 SNED1Q8TER0 1413 aa26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 STK31Q9BXU1 1019 aa26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF428Q96B54 188 aa26.48■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM89AQ96GI7 184 aa26.48■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 CACNA1FO60840 1977 aa26.48■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 RRAGCQ9HB90 399 aa26.47■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 TOMM70O94826 608 aa26.46■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.46■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.46■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 PSMD1Q99460 953 aa26.46■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 MYD88Q99836 296 aa26.46■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCC4O15439 1325 aa26.45■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 VAMP4O75379 141 aa26.45■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF521Q96K83 1311 aa26.45■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC4A2P04920 1241 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 KSR2Q6VAB6 950 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.43■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 G2E3Q7L622 706 aa26.43■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.43■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP350Q5VT06 3117 aa26.43■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 BBOX1O75936 387 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CCER2I3L3R5 266 aa26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 TAF1P21675 1872 aa26.41■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC51AQ86UW1 340 aa26.4■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR90Q96KV7 1748 aa26.4■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 GRAPQ13588 217 aa26.39■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
UBE2E3-201ENST00000392415 FLIIQ13045 1269 aa26.39■■□□□ 1.81
UBE2E3-201ENST00000392415 SP8Q8IXZ3 490 aa26.39■■□□□ 1.81
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