RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.77■■■□□ 2.2
AMIGO1-201ENST00000369862 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
AMIGO1-201ENST00000369862 TERF1P54274 439 aa28.76■■■□□ 2.19
AMIGO1-201ENST00000369862 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
AMIGO1-201ENST00000369862 SNX14Q9Y5W7 946 aa28.76■■■□□ 2.19
AMIGO1-201ENST00000369862 CABP4P57796 275 aa28.75■■■□□ 2.19
AMIGO1-201ENST00000369862 KLHDC4Q8TBB5 520 aa28.75■■■□□ 2.19
AMIGO1-201ENST00000369862 GPATCH3Q96I76 525 aa28.75■■■□□ 2.19
AMIGO1-201ENST00000369862 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa28.75■■■□□ 2.19
AMIGO1-201ENST00000369862 SIL1Q9H173 461 aa28.75■■■□□ 2.19
AMIGO1-201ENST00000369862 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
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AMIGO1-201ENST00000369862 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
AMIGO1-201ENST00000369862 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa28.74■■■□□ 2.19
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AMIGO1-201ENST00000369862 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa28.71■■■□□ 2.19
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AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC39Q9UFE4 941 aa28.7■■■□□ 2.18
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AMIGO1-201ENST00000369862 TTC14Q96N46 770 aa28.69■■■□□ 2.18
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPY26PQ9H489 355 aa28.69■■■□□ 2.18
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AMIGO1-201ENST00000369862 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.66■■■□□ 2.18
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AMIGO1-201ENST00000369862 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa28.66■■■□□ 2.18
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AMIGO1-201ENST00000369862 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.66■■■□□ 2.18
AMIGO1-201ENST00000369862 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
AMIGO1-201ENST00000369862 NBPF26B4DH59 902 aa28.65■■■□□ 2.18
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AMIGO1-201ENST00000369862 COPRSQ9NQ92 184 aa28.65■■■□□ 2.18
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AMIGO1-201ENST00000369862 BOLA2Q9H3K6 86 aa28.63■■■□□ 2.17
AMIGO1-201ENST00000369862 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.63■■■□□ 2.17
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AMIGO1-201ENST00000369862 RUFY3Q7L099 469 aa28.62■■■□□ 2.17
AMIGO1-201ENST00000369862 USP48Q86UV5 1035 aa28.62■■■□□ 2.17
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AMIGO1-201ENST00000369862 A0A087WZG4 1122 aa28.62■■■□□ 2.17
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AMIGO1-201ENST00000369862 KCNB2Q92953 911 aa28.61■■■□□ 2.17
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AMIGO1-201ENST00000369862 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.59■■■□□ 2.17
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AMIGO1-201ENST00000369862 HIP1O00291 1037 aa28.58■■■□□ 2.17
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AMIGO1-201ENST00000369862 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.58■■■□□ 2.17
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
AMIGO1-201ENST00000369862 PAPPAQ13219 1627 aa28.57■■■□□ 2.16
AMIGO1-201ENST00000369862 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
AMIGO1-201ENST00000369862 FSD1Q9BTV5 496 aa28.57■■■□□ 2.16
AMIGO1-201ENST00000369862 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
AMIGO1-201ENST00000369862 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.57■■■□□ 2.16
AMIGO1-201ENST00000369862 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
AMIGO1-201ENST00000369862 TNNI3KQ59H18 835 aa28.57■■■□□ 2.16
AMIGO1-201ENST00000369862 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
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