RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
ZNF548-201ENST00000336128 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
ZNF548-201ENST00000336128 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
ZNF548-201ENST00000336128 LMBR1LQ6UX01 489 aa15.22■□□□□ 0.03
ZNF548-201ENST00000336128 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
ZNF548-201ENST00000336128 GPATCH3Q96I76 525 aa15.22■□□□□ 0.03
ZNF548-201ENST00000336128 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa15.22■□□□□ 0.03
ZNF548-201ENST00000336128 ECHDC1Q9NTX5 307 aa15.22■□□□□ 0.03
ZNF548-201ENST00000336128 AK9Q5TCS8 1911 aa15.22■□□□□ 0.03
ZNF548-201ENST00000336128 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
ZNF548-201ENST00000336128 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
ZNF548-201ENST00000336128 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
ZNF548-201ENST00000336128 ARXQ96QS3 562 aa15.22■□□□□ 0.03
ZNF548-201ENST00000336128 HSCBQ8IWL3 235 aa15.21■□□□□ 0.03
ZNF548-201ENST00000336128 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
ZNF548-201ENST00000336128 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.21■□□□□ 0.03
ZNF548-201ENST00000336128 RREB1Q92766 1687 aa15.21■□□□□ 0.03
ZNF548-201ENST00000336128 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 CNTROBQ8N137 903 aa15.2■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 SNX21Q969T3 373 aa15.2■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 CHMP3Q9Y3E7 222 aa15.2■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 PALLDQ8WX93 1383 aa15.2■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 HLFQ16534 295 aa15.2■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 USP21Q9UK80 565 aa15.2■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.19■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 SIK1P57059 783 aa15.19■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 NBR1Q14596 966 aa15.19■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.19■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa15.19■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 ATP6V1AP38606 617 aa15.19■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC87Q9NVE4 849 aa15.19■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 KCNQ2O43526 872 aa15.18■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 TFCP2Q12800 502 aa15.17■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 ITPK1Q13572 414 aa15.17■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.17■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 GPTP24298 496 aa15.17■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 CRKLP46109 303 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 MYT1Q01538 1121 aa15.17■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 RABEP1Q15276 862 aa15.17■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 TNNI3KQ59H18 835 aa15.17■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 NLRP10Q86W26 655 aa15.17■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.17■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 NUP98P52948 1817 aa15.17■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 HSPA1LP34931 641 aa15.16■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 EIF5P55010 431 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 PLA2G12BQ9BX93 195 aa15.16■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.16■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.16■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF831Q5JPB2 1677 aa15.15■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 FAM89AQ96GI7 184 aa15.15■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 ANTXR1Q9H6X2 564 aa15.15■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 ANO2Q9NQ90 1003 aa15.15■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
ZNF548-201ENST00000336128 ATG9AQ7Z3C6 839 aa15.14■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 EVI5LQ96CN4 794 aa15.14■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 IL25Q9H293 177 aa15.14■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa15.14■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 EYA2O00167 538 aa15.13■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 IL15P40933 162 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 NHSQ6T4R5 1651 aa15.13■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 SGSM2O43147 1006 aa15.13■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 CIAO1O76071 339 aa15.13■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 MCCP23508 829 aa15.13■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.13■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa15.13■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 AFF2P51816 1311 aa15.12■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.12■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 CSF1RP07333 972 aa15.12■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC57Q2TAC2 916 aa15.12■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 LRRC24Q50LG9 513 aa15.12■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 SYNE4Q8N205 404 aa15.12■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 DBNDD2Q9BQY9 259 aa15.12■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 BOLA2Q9H3K6 86 aa15.12■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 ATP5JP18859 108 aa15.11■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 GPR108Q9NPR9 543 aa15.11■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF609O15014 1411 aa15.11■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 BTAF1O14981 1849 aa15.1■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 CAMTA2O94983 1202 aa15.1■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.1■□□□□ 0.01
ZNF548-201ENST00000336128 RUFY2Q8WXA3 655 aa15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms