RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323301.8

LRSAM1-202, Transcript of leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LRSAM1, Length 3,376 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1-202ENST00000323301 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 FERMT3Q86UX7 667 aa14.92□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 UBE2HP62256 183 aa14.91□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 VPS53Q5VIR6 699 aa14.91□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.91□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 ME3Q16798 604 aa14.91□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.91□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.91□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.91□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 KAZALD1Q96I82 304 aa14.91□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 MYD88Q99836 296 aa14.9□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.9□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.9□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 A0A0D9SFI3 127 aa14.9□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 STK3Q13188 491 aa14.9□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 MTMR6Q9Y217 621 aa14.9□□□□□ -0.02
LRSAM1-202ENST00000323301 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 NECTIN1Q15223 517 aa14.89□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.89□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.89□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.89□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.89□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.89□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.89□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 COPS6Q7L5N1 327 aa14.88□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa14.88□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 SLC27A2O14975 620 aa14.88□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 IGKV5-2P06315 115 aa14.88□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.88□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 HIP1O00291 1037 aa14.88□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 ADCY5O95622 1261 aa14.88□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.88□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.88□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.88□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.88□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.87□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 ST3GAL1Q11201 340 aa14.87□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 FAM13BQ9NYF5 915 aa14.87□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.87□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 PSMA5P28066 241 aa14.87□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 ZNF790Q6PG37 636 aa14.87□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.87□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.87□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.87□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 UQCRHP07919 91 aa14.87□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 MCM5P33992 734 aa14.87□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.87□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 RNF20Q5VTR2 975 aa14.87□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.86□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.86□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 MAP4K1Q92918 833 aa14.86□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 USP54Q70EL1 1684 aa14.86□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 PDIA6Q15084 440 aa14.86□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.86□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.86□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.86□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.85□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 NCAPD2Q15021 1401 aa14.85□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.85□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 ZMYND15Q9H091 742 aa14.85□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 GCKRQ14397 625 aa14.85□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 CAMK4Q16566 473 aa14.85□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 ARID3AQ99856 593 aa14.85□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 UVSSAQ2YD98 709 aa14.84□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.84□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.84□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.84□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 CHGBP05060 677 aa14.84□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 KRT85P78386 507 aa14.84□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 USP16Q9Y5T5 823 aa14.84□□□□□ -0.03
LRSAM1-202ENST00000323301 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LRSAM1-202ENST00000323301 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.83□□□□□ -0.04
LRSAM1-202ENST00000323301 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.83□□□□□ -0.04
LRSAM1-202ENST00000323301 TFCP2Q12800 502 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.8 ms