RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301730.12

RNPS1-201, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,276 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-201ENST00000301730 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.54■■□□□ 1.84
RNPS1-201ENST00000301730 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
RNPS1-201ENST00000301730 YY1P25490 414 aa26.53■■□□□ 1.84
RNPS1-201ENST00000301730 G2E3Q7L622 706 aa26.53■■□□□ 1.84
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
RNPS1-201ENST00000301730 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.53■■□□□ 1.84
RNPS1-201ENST00000301730 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.53■■□□□ 1.84
RNPS1-201ENST00000301730 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
RNPS1-201ENST00000301730 STYK1Q6J9G0 422 aa26.52■■□□□ 1.84
RNPS1-201ENST00000301730 MASTLQ96GX5 879 aa26.52■■□□□ 1.84
RNPS1-201ENST00000301730 CACNA1SQ13698 1873 aa26.51■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 ADCY9O60503 1353 aa26.5■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.5■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 NPR1P16066 1061 aa26.49■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 FLIIQ13045 1269 aa26.49■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 CRY2Q49AN0 593 aa26.49■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 KSR2Q6VAB6 950 aa26.49■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 SLX4Q8IY92 1834 aa26.49■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.48■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.48■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.48■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 CNKSR1Q969H4 720 aa26.48■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 MYD88Q99836 296 aa26.48■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.48■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.47■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.46■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 SYNE4Q8N205 404 aa26.46■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF428Q96B54 188 aa26.46■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 LAMB2P55268 1798 aa26.46■■□□□ 1.83
RNPS1-201ENST00000301730 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.45■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.43■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.43■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 NLRP3Q96P20 1036 aa26.43■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 C21orf2O43822 256 aa26.42■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 FAM89AQ96GI7 184 aa26.42■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 IGKV5-2P06315 115 aa26.4■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 ALDH1B1P30837 517 aa26.4■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.4■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 SBF1O95248 1867 aa26.39■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.39■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.39■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.39■■□□□ 1.82
RNPS1-201ENST00000301730 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 NFKBIEO00221 500 aa26.37■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 RASSF7Q02833 373 aa26.37■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.37■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.36■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 SOGA3Q5TF21 947 aa26.36■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.35■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 F6X3S4 739 aa26.34■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 ABCC4O15439 1325 aa26.34■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 PRELPP51888 382 aa26.33■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.33■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 CCDC93Q567U6 631 aa26.33■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.33■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 LINS1Q8NG48 757 aa26.33■■□□□ 1.81
RNPS1-201ENST00000301730 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 OLFM4Q6UX06 510 aa26.32■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.32■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.32■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.32■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.32■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 SNED1Q8TER0 1413 aa26.31■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.31■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 RNF181Q9P0P0 153 aa26.31■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 TAF1P21675 1872 aa26.3■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 LMNB1P20700 586 aa26.3■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 GCKRQ14397 625 aa26.3■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.3■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 BEND3Q5T5X7 828 aa26.29■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 H7C1W4 665 aa26.28■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 PDE8AO60658 829 aa26.28■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 SLC51AQ86UW1 340 aa26.28■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.28■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 PTPRCP08575 1304 aa26.28■■□□□ 1.8
RNPS1-201ENST00000301730 MYH3P11055 1940 aa26.27■■□□□ 1.8
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