RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298527.10

CLEC1B-201, Transcript of C-type lectin domain family 1 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC1B, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1B-201ENST00000298527 NYXQ9GZU5 481 aa21.6■■□□□ 1.05
CLEC1B-201ENST00000298527 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.6■■□□□ 1.05
CLEC1B-201ENST00000298527 CA12O43570 354 aa21.59■■□□□ 1.05
CLEC1B-201ENST00000298527 SCNN1DP51172 638 aa21.59■■□□□ 1.05
CLEC1B-201ENST00000298527 NBPF26B4DH59 902 aa21.58■■□□□ 1.05
CLEC1B-201ENST00000298527 EPS15P42566 896 aa21.58■■□□□ 1.05
CLEC1B-201ENST00000298527 GRM1Q13255 1194 aa21.58■■□□□ 1.05
CLEC1B-201ENST00000298527 CST9Q5W186 159 aa21.58■■□□□ 1.05
CLEC1B-201ENST00000298527 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CLEC1B-201ENST00000298527 NBPF15Q8N660 670 aa21.58■■□□□ 1.05
CLEC1B-201ENST00000298527 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.57■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.57■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 LTBP1Q14766 1721 aa21.57■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 HLFQ16534 295 aa21.56■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 MCM10Q7L590 875 aa21.56■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 CFAP53Q96M91 514 aa21.56■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.56■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 COL4A5P29400 1685 aa21.55■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.55■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.54■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 TRAF5O00463 557 aa21.54■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 NIM1KQ8IY84 436 aa21.54■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.54■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.54■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 ABCC12Q96J65 1359 aa21.53■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.53■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 VPS33BQ9H267 617 aa21.53■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 AOC2O75106 756 aa21.52■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 DCTN1Q14203 1278 aa21.52■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.52■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.52■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.52■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 TSKSQ9UJT2 592 aa21.52■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 NUDCQ9Y266 331 aa21.52■■□□□ 1.04
CLEC1B-201ENST00000298527 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.51■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.51■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 NUP98P52948 1817 aa21.5■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 NGEFQ8N5V2 710 aa21.5■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 CFAP44Q96MT7 982 aa21.5■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 PPIP5K2O43314 1243 aa21.49■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.49■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.48■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.47■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.47■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 AOC3Q16853 763 aa21.46■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.46■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.46■■□□□ 1.03
CLEC1B-201ENST00000298527 DGKZQ13574 1117 aa21.45■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.45■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CXCL9Q07325 125 aa21.44■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SUSD4Q5VX71 490 aa21.44■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.44■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.44■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.44■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 GPTP24298 496 aa21.43■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 NOGQ13253 232 aa21.43■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.43■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.43■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.43■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.43■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 NLRP3Q96P20 1036 aa21.43■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 NTSR2O95665 410 aa21.42■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.42■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.42■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 TNIP1Q15025 636 aa21.41■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.41■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.41■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 MYL6BP14649 208 aa21.4■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PPP2R1AP30153 589 aa21.4■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PARP10Q53GL7 1025 aa21.4■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC51AQ86UW1 340 aa21.4■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.4■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.4■■□□□ 1.02
CLEC1B-201ENST00000298527 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.39■■□□□ 1.01
CLEC1B-201ENST00000298527 BBOX1O75936 387 aa21.38■■□□□ 1.01
CLEC1B-201ENST00000298527 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.38■■□□□ 1.01
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms