RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291901.12

TNNT1-201, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNNT1, Length 967 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-201ENST00000291901 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 NTSR2O95665 410 aa22■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 ERBB4Q15303 1308 aa22■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.99■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.99■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 SNED1Q8TER0 1413 aa21.98■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.98■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 LDHDQ86WU2 507 aa21.98■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 HACL1Q9UJ83 578 aa21.98■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.98■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.98■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 COL4A5P29400 1685 aa21.98■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 FZD9O00144 591 aa21.97■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.97■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 JDP2Q8WYK2 163 aa21.97■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 PSMD1Q99460 953 aa21.97■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 LAMB2P55268 1798 aa21.97■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.97■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 EPHX2P34913 555 aa21.96■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 KRT24Q2M2I5 525 aa21.96■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 CREBZFQ9NS37 354 aa21.96■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.96■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TNNT1-201ENST00000291901 PARP10Q53GL7 1025 aa21.95■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 COPS6Q7L5N1 327 aa21.95■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF428Q96B54 188 aa21.95■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 NLRP3Q96P20 1036 aa21.95■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.95■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.95■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.94■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 GPC2Q8N158 579 aa21.94■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.94■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.94■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 TAF1P21675 1872 aa21.93■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.14e-7■□□□□ 9.2
TNNT1-201ENST00000291901 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.93■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 PASKQ96RG2 1323 aa21.93■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 RUNDC1Q96C34 613 aa21.92■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.92■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 LTBP1Q14766 1721 aa21.91■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 ABCC4O15439 1325 aa21.9■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 CHL1O00533 1208 aa21.9■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.9■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 NLRP10Q86W26 655 aa21.9■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.9■■□□□ 1.1
TNNT1-201ENST00000291901 CAPN15O75808 1086 aa21.89■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 TNS4Q8IZW8 715 aa21.89■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.89■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.88■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 PPIP5K2O43314 1243 aa21.88■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 AOC3Q16853 763 aa21.88■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.88■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.88■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 CNTROBQ8N137 903 aa21.88■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.88■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 EPS15P42566 896 aa21.87■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 TCIRG1Q13488 830 aa21.87■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 NIM1KQ8IY84 436 aa21.87■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 CNTNAP1P78357 1384 aa21.87■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.86■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 SCNN1DP51172 638 aa21.85■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 VEGFBP49765 207 aa21.84■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.83■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 BBOX1O75936 387 aa21.83■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
TNNT1-201ENST00000291901 SP8Q8IXZ3 490 aa21.82■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 MPNDQ8N594 471 aa21.82■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.81■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.81■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.81■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.81■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.81■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 FAM89AQ96GI7 184 aa21.81■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 FOXN1O15353 648 aa21.8■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 CXCL9Q07325 125 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms