RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 CALML4Q96GE6 196 aa24.36■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.35■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 MICU3Q86XE3 530 aa24.35■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.35■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.35■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC96Q2M329 555 aa24.35■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.35■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 NUP160Q12769 1436 aa24.35■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 UBA7P41226 1012 aa24.34■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 BRF1Q92994 677 aa24.34■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 CUL5Q93034 780 aa24.34■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 LDHCP07864 332 aa24.34■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 SNRKQ9NRH2 765 aa24.34■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 ACEP12821 1306 aa24.34■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.34■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 IFFO1Q0D2I5 559 aa24.34■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.34■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 FAM107BQ9H098 131 aa24.34■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.33■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.33■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 CEP135Q66GS9 1140 aa24.33■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH1L1O75891 902 aa24.33■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 HAND2P61296 217 aa24.33■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 PDE4BQ07343 736 aa24.33■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.33■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.33■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC91Q7Z6B0 441 aa24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 BMP15O95972 392 aa24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 CETN1Q12798 172 aa24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 CLCN1P35523 988 aa24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 ATP8B2P98198 1209 aa24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 GPTP24298 496 aa24.31■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 SYKP43405 635 aa24.31■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 EHBP1Q8NDI1 1231 aa24.31■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.31■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf34Q49A92 452 aa24.31■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 MICALCLQ6ZW33 695 aa24.31■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.3■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 DNAI2Q9GZS0 605 aa24.3■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.3■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.3■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC40Q4G0X9 1142 aa24.3■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.3■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 MYZAPP0CAP1 466 aa24.3■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 IDEP14735 1019 aa24.3■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 GNG11P61952 73 aa24.3■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.3■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.29■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 PANK2Q9BZ23 570 aa24.29■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 RMND1Q9NWS8 449 aa24.29■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa24.29■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 NECAB1Q8N987 351 aa24.29■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 TSPY2A6NKD2 308 aa24.29■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.29■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 KAT14Q9H8E8 782 aa24.29■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 TMTC2Q8N394 836 aa24.29■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 BAG3O95817 575 aa24.28■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.28■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 USP48Q86UV5 1035 aa24.28■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.28■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.28■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 FANCAO15360 1455 aa24.28■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 NEBLO76041 1014 aa24.28■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 N4BP3O15049 544 aa24.28■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.28■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.27■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 KRT23Q9C075 422 aa24.27■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 SPECC1Q5M775 1068 aa24.27■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 DNA2P51530 1060 aa24.27■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 EXOC5O00471 708 aa24.27■■□□□ 1.48
CCSAP-201ENST00000284617 F13A1P00488 732 aa24.26■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 UBASH3AP57075 661 aa24.26■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms