RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000212015.10

SIRT1-201, Transcript of sirtuin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIRT1, Length 4,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1-201ENST00000212015 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.65■□□□□ 0.9
SIRT1-201ENST00000212015 Q6ZUG5 572 aa20.65■□□□□ 0.9
SIRT1-201ENST00000212015 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.65■□□□□ 0.9
SIRT1-201ENST00000212015 USP44Q9H0E7 712 aa20.65■□□□□ 0.9
SIRT1-201ENST00000212015 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
SIRT1-201ENST00000212015 NEK1Q96PY6 1258 aa20.64■□□□□ 0.9
SIRT1-201ENST00000212015 TRIM29Q14134 588 aa20.64■□□□□ 0.89
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SIRT1-201ENST00000212015 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.63■□□□□ 0.89
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SIRT1-201ENST00000212015 PTPN21Q16825 1174 aa20.63■□□□□ 0.89
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SIRT1-201ENST00000212015 EYA1Q99502 592 aa20.63■□□□□ 0.89
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SIRT1-201ENST00000212015 CCDC102AQ96A19 550 aa20.61■□□□□ 0.89
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SIRT1-201ENST00000212015 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 KCNF1Q9H3M0 494 aa20.6■□□□□ 0.89
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SIRT1-201ENST00000212015 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.6■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 MAP3K19Q56UN5 1328 aa20.6■□□□□ 0.89
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SIRT1-201ENST00000212015 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.59■□□□□ 0.89
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SIRT1-201ENST00000212015 FAM193AP78312 1265 aa20.58■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 GOLIM4O00461 696 aa20.58■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 C8orf76Q96K31 380 aa20.58■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.58■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 SLC27A2O14975 620 aa20.57■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 MYD88Q99836 296 aa20.57■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 PHACTR2O75167 634 aa20.57■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.57■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 PIK3R4Q99570 1358 aa20.57■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 NEMFO60524 1076 aa20.57■□□□□ 0.88
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SIRT1-201ENST00000212015 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.56■□□□□ 0.88
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SIRT1-201ENST00000212015 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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SIRT1-201ENST00000212015 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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SIRT1-201ENST00000212015 USP27XA6NNY8 438 aa20.54■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 CTAGE5O15320 804 aa20.54■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 NEK11Q8NG66 645 aa20.54■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 PTCH1Q13635 1447 aa20.54■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 UBASH3AP57075 661 aa20.54■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.54■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 ATP7AQ04656 1500 aa20.54■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 CLTCL1P53675 1640 aa20.54■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
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