RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arap3Q8R5G7 1538 aa7.86□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 1700006A11RikB9EHI3 544 aa7.86□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa7.86□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ddx11Q6AXC6 880 aa7.86□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zbtb3Q91X45 518 aa7.86□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spock2Q9ER58 423 aa7.86□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa7.86□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BcorQ8CGN4 1759 aa7.86□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eef2kO08796 724 aa7.86□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim30aP15533 496 aa7.86□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tyro3P55144 880 aa7.86□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Leo1Q5XJE5 667 aa7.86□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc35g1Q8BY79 368 aa7.86□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp113Q8C689 439 aa7.86□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Irx4Q9QY61 515 aa7.86□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ugt1a5B2RT14 529 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cspp1B2RX88 1205 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lmod3E9QA62 571 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10563F6WIE4 79 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp2b3Q0VF55 1220 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map3k2Q61083 619 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp251Q6PCX8 632 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Polr3dQ91WD1 398 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tpd52l1O54818 204 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ets1P27577 440 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nkx2-3P97334 362 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cfap157Q0VFX2 523 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm973E9Q295 1059 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Oas2E9Q9A9 742 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sass6Q80UK7 654 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8BT18 775 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa7.85□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd11Q6GQW0 1109 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ubxn10Q8BG34 277 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sp8Q8BMJ8 486 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nrbp1Q99J45 535 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Amotl1Q9D4H4 968 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TnmdQ9EP64 317 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aox1O54754 1333 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col1a2Q01149 1372 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rims2Q9EQZ7 1530 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klhl34A2AI76 644 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mctp1E9PV86 951 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hmx1O70218 332 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lnx1O70263 728 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FanccP50652 591 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lins1Q3U1D0 764 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kiaa0753Q6A000 959 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Me3Q8BMF3 604 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SnrkQ8VDU5 748 aa7.84□□□□□ -1.15
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp10bB1AWN4 1474 aa7.84□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MycnP03966 462 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MecomP14404 1042 aa7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mdm2P23804 489 aa7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ano6Q6P9J9 911 aa7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttc27Q8CD92 847 aa7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plcd3Q8K2J0 785 aa7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nop14Q8R3N1 860 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AceP09470 1312 aa7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc26a8Q8R0C3 999 aa7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atf7Q8R0S1 413 aa7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plcd1Q8R3B1 756 aa7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fmnl2A2APV2 1086 aa7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RdxP26043 583 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 U2af2P26369 475 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ubash3aQ3V3E1 624 aa7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa7.83□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Flt4P35917 1363 aa7.82□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdkn1cP49919 348 aa7.82□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pde3bQ61409 1100 aa7.82□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rad17Q6NXW6 688 aa7.82□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rps6kb1Q8BSK8 525 aa7.82□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cep57l1Q8VDS7 400 aa7.82□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt85Q9Z2T6 507 aa7.82□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ctdnep1Q3TP92 244 aa7.82□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dixdc1Q80Y83 711 aa7.82□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnajc5gQ8C632 165 aa7.82□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bicd2Q921C5 820 aa7.82□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ZwintQ9CQU5 252 aa7.82□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mst1rQ62190 1378 aa7.82□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa7.81□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hmgn5Q9JL35 406 aa7.81□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa7.81□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abcc12Q80WJ6 1366 aa7.81□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adam1bQ8R534 806 aa7.81□□□□□ -1.16
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GckrQ91X44 587 aa7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.2 ms