RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pank1Q8K4K6 548 aa27.55■■■□□ 2
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bend3Q6PAL0 825 aa27.54■■■□□ 2
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nutm1Q8BHP2 1126 aa27.54■■■□□ 2
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp646Q6NV66 1788 aa27.53■■■□□ 2
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Foxo3Q9WVH4 672 aa27.53■■■□□ 2
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fkbp5Q64378 456 aa27.52■■■□□ 2
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Isca1Q9D924 129 aa27.52■■■□□ 2
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ptf1aQ9QX98 324 aa27.52■■■□□ 2
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Col24a1Q30D77 1733 aa27.52■■■□□ 2
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ttc5Q99LG4 440 aa27.51■■□□□ 1.99
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa27.51■■□□□ 1.99
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zap70P43404 618 aa27.49■■□□□ 1.99
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eva1cP58659 440 aa27.49■■□□□ 1.99
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Soga3Q6NZL0 945 aa27.49■■□□□ 1.99
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atp6v0a2P15920 856 aa27.48■■□□□ 1.99
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cwc25Q9DBF7 416 aa27.47■■□□□ 1.99
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Stard3nlQ9DCI3 235 aa27.47■■□□□ 1.99
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ehd4Q9EQP2 541 aa27.47■■□□□ 1.99
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nup188Q6ZQH8 1759 aa27.47■■□□□ 1.99
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa27.45■■□□□ 1.99
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ankrd44B2RXR6 993 aa27.45■■□□□ 1.98
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PgfP49764 158 aa27.44■■□□□ 1.98
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Btaf1E9QAE3 1848 aa27.44■■□□□ 1.98
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Flt1P35969 1333 aa27.43■■□□□ 1.98
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NpcdF8VQB8 469 aa27.43■■□□□ 1.98
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Golgb1E9PVZ8 3238 aa27.42■■□□□ 1.98
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Csf1rP09581 977 aa27.42■■□□□ 1.98
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Map3k13Q1HKZ5 959 aa27.42■■□□□ 1.98
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Phf23Q8BSN5 401 aa27.42■■□□□ 1.98
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Myh1Q5SX40 1942 aa27.41■■□□□ 1.98
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Aknad1E9Q8N6 675 aa27.41■■□□□ 1.98
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NmiO35309 314 aa27.41■■□□□ 1.98
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam213aQ9CYH2 218 aa27.4■■□□□ 1.98
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fgd1P52734 960 aa27.38■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm7347D3YYI9 267 aa27.37■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Speer4aF8VPX6 267 aa27.37■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igflr1Q3U4N7 345 aa27.37■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp48Q3V0C5 1052 aa27.37■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gja3Q64448 417 aa27.37■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gpr101Q80T62 511 aa27.37■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tnnt3Q9QZ47 272 aa27.37■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mical3Q8CJ19 1993 aa27.37■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp19a1P28649 503 aa27.36■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Psd3Q2PFD7 1037 aa27.36■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gja10Q9WUS4 505 aa27.36■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mum1Q6DID5 682 aa27.35■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Clca2Q8BG22 942 aa27.35■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 GptQ8QZR5 496 aa27.35■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Foxo4Q9WVH3 505 aa27.35■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cops6O88545 324 aa27.34■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Insm1Q63ZV0 521 aa27.34■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 WaslQ91YD9 501 aa27.34■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp2ab1S4R196 498 aa27.34■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scn9aQ62205 1984 aa27.33■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PnnO35691 725 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CanxP35564 591 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Map3k9Q3U1V8 1077 aa27.33■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tspyl2Q7TQI8 677 aa27.33■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf521Q6KAS7 1311 aa27.33■■□□□ 1.97
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 UtrnE9Q6R7 3430 aa27.33■■□□□ 1.97
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ttc19Q8CC21 365 aa27.32■■□□□ 1.96
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Stk36Q69ZM6 1316 aa27.32■■□□□ 1.96
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ltn1Q6A009 1767 aa27.32■■□□□ 1.96
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Chrna5Q2MKA5 467 aa27.31■■□□□ 1.96
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gnat3Q3V3I2 354 aa27.31■■□□□ 1.96
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Greb1lB9EJV3 1913 aa27.3■■□□□ 1.96
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prkar2bP31324 416 aa27.29■■□□□ 1.96
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rbm46P86049 533 aa27.29■■□□□ 1.96
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SobpQ0P5V2 864 aa27.29■■□□□ 1.96
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