RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 IL12BP29460 328 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 PPICP45877 212 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 EMDP50402 254 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 UCNP55089 124 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 CDK6Q00534 326 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 PLCXD2Q0VAA5 305 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 ATP1A4Q13733 1029 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 SCARB2Q14108 478 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 VEZF1Q14119 521 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 SELPLGQ14242 412 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 FLOT2Q14254 428 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 TGIF1Q15583 401 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 DECR1Q16698 335 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 MSMPQ1L6U9 139 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 VMACQ2NL98 169 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 GPAT3Q53EU6 434 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 FAM69BQ5VUD6 431 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 VASH2Q86V25 355 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 CALHM3Q86XJ0 350 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 PROSER1Q86XN7 944 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 C9orf40Q8IXQ3 194 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 MICU2Q8IYU8 434 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 HORMAD2Q8N7B1 307 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 APCDD1LQ8NCL9 501 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 OR5D16Q8NGK9 328 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 BBS10Q8TAM1 723 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 RASSF5Q8WWW0 418 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 OIT3Q8WWZ8 545 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 CDS1Q92903 461 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 HSPBAP1Q96EW2 488 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 NUDT9Q9BW91 350 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 DEFB126Q9BYW3 111 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 TRIM8Q9BZR9 551 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 POLE3Q9NRF9 147 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 ABI3Q9P2A4 366 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 IL17BQ9UHF5 180 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 POLHQ9Y253 713 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 A8MVJ9 347 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 HRKO00198 91 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 CLPSP04118 112 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 SERPINA7P05543 415 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 OR12D1P0DN82 309 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 ACP2P11117 423 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 NQO1P15559 274 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 S1PR1P21453 382 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 DRD5P21918 477 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 F8A1P23610 371 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 LCN1P31025 176 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 GABRA3P34903 492 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 GPR143P51810 404 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 MVDP53602 400 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 POLE2P56282 527 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 RPP38P78345 283 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 CDC20Q12834 499 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 DUSP5Q16690 384 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 DCST2Q5T1A1 773 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 REEP3Q6NUK4 255 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 DHFR2Q86XF0 187 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 C10orf67Q8IYJ2 551 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 RNF148Q8N7C7 305 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF527Q8NB42 609 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 SLC16A11Q8NCK7 471 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 ELP5Q8TE02 316 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 XAGE5Q8WWM1 108 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 PMM1Q92871 262 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 FAM162AQ96A26 154 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF607Q96SK3 696 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 CBLCQ9ULV8 474 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 ERVK-11Q9UQG0 969 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-211ENST00000497210 WDR45Q9Y484 360 aa8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 206.2 ms