RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA0040Q15053 153 aa23.66■■□□□ 1.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIPMQ5VYY2 423 aa23.66■■□□□ 1.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC6AQ6EIG7 209 aa23.66■■□□□ 1.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DUSP19Q8WTR2 217 aa23.66■■□□□ 1.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C3orf14Q9HBI5 128 aa23.66■■□□□ 1.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGS14O43566 566 aa23.65■■□□□ 1.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPOXP36551 454 aa23.65■■□□□ 1.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KEAP1Q14145 624 aa23.65■■□□□ 1.38
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RTN4RQ9BZR6 473 aa23.65■■□□□ 1.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa23.65■■□□□ 1.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRTM1Q9HBL6 345 aa23.65■■□□□ 1.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf109Q9NX04 203 aa23.65■■□□□ 1.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF337Q9Y3M9 751 aa23.65■■□□□ 1.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa23.65■■□□□ 1.38
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDPK1O15530 556 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DIAPH2O60879 1101 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATE1O95260 518 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HRGP04196 525 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT4P19013 534 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GABRA3P34903 492 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSPB3Q12988 150 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POU4F3Q15319 338 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRN4CLQ8ND94 238 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EQTNQ9NQ60 294 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDRG3Q9UGV2 375 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MID2Q9UJV3 735 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2M5A3KFT3 312 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPIPB8E9PQR5 432 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASKO14936 926 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AZIN1O14977 448 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNH1O95259 989 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UTS2O95399 124 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPC1P35052 558 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDN15P56746 228 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5M1Q8NGP8 315 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STARD4Q96DR4 205 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIGQQ9BRB3 760 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FIS1Q9Y3D6 152 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GXYLT2A0PJZ3 443 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H0YC42 278 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEC14L5O43304 696 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNFRSF21O75509 655 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRPS2P11908 318 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C17orf67Q0P5P2 114 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEFB113Q30KQ7 82 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C10orf107Q8IVU9 208 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C4orf33Q8N1A6 199 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFP28Q8NHY6 868 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR151Q8TDV0 419 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMPDL3BQ92485 455 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FIG4Q92562 907 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIK3R3Q92569 461 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCT7Q99832 543 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 REEP4Q9H6H4 257 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACANP16112 2415 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H3BML4 177 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AKAP10O43572 662 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANGPTL1O95841 491 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEFHP12036 1026 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS26BQ4G0F5 336 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VWA1Q6PCB0 445 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q6ZSR9 355 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2T11Q8NH01 316 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP70Q8NHQ1 597 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPCDCQ96CD2 204 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FCRL1Q96LA6 429 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRMOQ9BU70 441 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PINK1Q9BXM7 581 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP23.6■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBX19O60806 448 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHEK2O96017 543 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV1D-16P01601 117 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SDC1P18827 310 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKAG1P54619 331 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDN20P56880 219 aa23.6■■□□□ 1.37
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