RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424161.5

TTC28-AS1-204, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 556 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NME4O00746 187 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ABCB7O75027 752 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KCNK2O95069 426 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ALPPP05187 535 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ARAFP10398 606 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NAGAP17050 411 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ABCD3P28288 659 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KRT20P35900 424 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SSR4P51571 173 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RBBP4Q09028 425 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PLCXD2Q0VAA5 305 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GNA13Q14344 377 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DECR1Q16698 335 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CYP51A1Q16850 503 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SPATS1Q496A3 300 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DCST2Q5T1A1 773 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GCNT6Q5T4J0 391 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FCRLBQ6BAA4 426 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ISLR2Q6UXK2 745 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 C16orf62Q7Z3J2 963 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CALHM3Q86XJ0 350 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ARHGAP24Q8N264 748 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 C10orf111Q8N326 155 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 METTL25Q8N6Q8 603 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FDCSPQ8NFU4 85 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 OR10A6Q8NH74 314 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FAM110BQ8TC76 370 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PIK3R3Q92569 461 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RAB8BQ92930 207 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 G6PC3Q9BUM1 346 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TMEM38AQ9H6F2 299 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 A4GALTQ9NPC4 353 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 POLE3Q9NRF9 147 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CMTM6Q9NX76 183 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KCNE3Q9Y6H6 103 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FAM220BPB1ANY3 271 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GYG2O15488 501 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PPM1BO75688 479 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IL33O95760 270 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GUSBP08236 651 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TFPTP0C1Z6 253 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FBXO45P0C2W1 286 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LCN1P31025 176 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GZMMP51124 257 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FUT5Q11128 374 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ADRM1Q16186 407 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TBR1Q16650 682 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 AP1ARQ63HQ0 302 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ERICH5Q6P6B1 374 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LYPD8Q6UX82 237 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PTOV1Q86YD1 416 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BEST3Q8N1M1 668 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BCORP1Q8N888 145 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 C11orf65Q8NCR3 313 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 OR4N2Q8NGD1 307 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ASB15Q8WXK1 588 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DIO2Q92813 273 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TMBIM1Q969X1 311 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 OMA1Q96E52 524 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF583Q96ND8 569 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LMF1Q96S06 567 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BTBD10Q9BSF8 475 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF350Q9GZX5 532 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RNF32Q9H0A6 362 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ALG2Q9H553 416 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 STMN3Q9NZ72 180 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ADA2Q9NZK5 511 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CALML5Q9NZT1 146 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ACACBO00763 2458 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TPRP12270 2363 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 OR6C70A6NIJ9 312 aa12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MKRN2OSH3BPM6 223 aa12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MAN1A2O60476 641 aa12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TSPAN2O60636 221 aa12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 STX11O75558 287 aa12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-204ENST00000424161 REM1O75628 298 aa12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms