RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	T	O15178	435 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	CT45A8	P0DMV1	189 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	CT45A9	P0DMV2	189 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	DRD5	P21918	477 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	PPIC	P45877	212 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPINB8	P50452	374 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	GAS1	P54826	345 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	KLC3	Q6P597	504 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF138	Q8WVD3	245 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	STARD4	Q96DR4	205 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC35A4	Q96G79	324 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	MARK4	Q96L34	752 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	SFXN2	Q96NB2	322 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	COL21A1	Q96P44	957 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	BTBD9	Q96Q07	612 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	VPS11	Q9H270	941 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	XPR1	Q9UBH6	696 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	STAB1	Q9NY15	2570 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	CUBN	O60494	3623 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ESYT3	A0FGR9	886 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338		H0YC42	278 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	STX16	O14662	325 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	MSTN	O14793	375 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	CASK	O14936	926 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGEF9	O43307	516 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ZIC3	O60481	467 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPAN2	O60636	221 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	SMPD2	O60906	423 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68	4e-17	■□□□□ 10.2
TTLL3-233	ENST00000602338	PDYN	P01213	254 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPAN8	P19075	237 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	CHM	P24386	653 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	GRK2	P25098	689 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	PCSK6	P29122	969 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	TYK2	P29597	1187 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGEA12	P43365	314 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ALDH9A1	P49189	494 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	DIO3	P55073	304 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	CLDN15	P56746	228 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	IFT88	Q13099	833 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	GAB1	Q13480	694 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	AAGAB	Q6PD74	315 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	P3H2	Q8IVL5	708 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	NUDT8	Q8WV74	236 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	PERP	Q96FX8	193 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	VSTM2L	Q96N03	204 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ADO	Q96SZ5	270 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	PIP5K1A	Q99755	562 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	AHSP	Q9NZD4	102 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF225	Q9UK10	706 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	DKKL1	Q9UK85	242 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC22A20	A6NK97	555 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	REM1	O75628	298 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	SBK3	P0C264	359 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	CRYGS	P22914	178 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	DPP4	P27487	766 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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