RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 SLC39A3Q9BRY0 314 aa16.91■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa16.9■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 SAGE2PA6NJ88 616 aa16.9■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 SLC6A2P23975 617 aa16.9■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 MC3RP41968 323 aa16.9■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 CCT3P49368 545 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 PSME3P61289 254 aa16.9■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 NANOGP8Q6NSW7 305 aa16.9■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 OR8J3Q8NGG0 315 aa16.9■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 MOAP1Q96BY2 351 aa16.9■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 SLX1AQ9BQ83 275 aa16.9■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 NANOGQ9H9S0 305 aa16.9■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 DNAL1Q4LDG9 190 aa16.89■□□□□ 0.29
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PTX4-201ENST00000293922 SSC4DQ8WTU2 575 aa16.87■□□□□ 0.29
PTX4-201ENST00000293922 TMEM125Q96AQ2 219 aa16.87■□□□□ 0.29
PTX4-201ENST00000293922 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa16.87■□□□□ 0.29
PTX4-201ENST00000293922 OLAHQ9NV23 265 aa16.87■□□□□ 0.29
PTX4-201ENST00000293922 ANKRD10Q9NXR5 420 aa16.87■□□□□ 0.29
PTX4-201ENST00000293922 TMEM181Q9P2C4 612 aa16.87■□□□□ 0.29
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