RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 TDGQ13569 410 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 SNX29P2Q8IUI4 249 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 ZNF619Q8N2I2 560 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 NEIL3Q8TAT5 605 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 ZNF480Q8WV37 535 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 LRRN3E7EW58 273 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 CSN2P05814 226 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 RIDAP52758 137 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 LRRN3Q9H3W5 708 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 A0A1W2PPW3 197 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 CIB4A0PJX0 185 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 MT-ND2P03891 347 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 EN2P19622 333 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 RAB39AQ14964 217 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 CTSL3PQ5NE16 218 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa16.15■□□□□ 0.18
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NISCH-213ENST00000489895 GPR137CQ8N3F9 429 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 SFXN5Q8TD22 340 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 MCOLN1Q9GZU1 580 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 A0A0U1RQS6 177 aa16.15■□□□□ 0.18
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NISCH-213ENST00000489895 HHLA1C9JL84 531 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 CAPZA1P52907 286 aa16.15■□□□□ 0.18
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NISCH-213ENST00000489895 KCTD11Q693B1 232 aa16.15■□□□□ 0.18
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NISCH-213ENST00000489895 GPX3P22352 226 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 PRKCDQ05655 676 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 MS4A15Q8N5U1 240 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 MGLLQ99685 303 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 INPP5KQ9BT40 448 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 LINC01553A4QN01 128 aa16.14■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 C17orf105B2RV13 164 aa16.14■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 TANGO2Q6ICL3 276 aa16.14■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 DENND6BQ8NEG7 585 aa16.14■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 HDAC8Q9BY41 377 aa16.14■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 ACPTQ9BZG2 426 aa16.14■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa16.14■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 TMEM181Q9P2C4 612 aa16.14■□□□□ 0.18
NISCH-213ENST00000489895 SLX4Q8IY92 1834 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 UBL4AP11441 157 aa16.14■□□□□ 0.17
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NISCH-213ENST00000489895 FOXA1P55317 472 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
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NISCH-213ENST00000489895 VTCN1Q7Z7D3 282 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 TESCQ96BS2 214 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 ZIC5Q96T25 663 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 ENAMQ9NRM1 1142 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 ERVK-18Q9QC07 812 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
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NISCH-213ENST00000489895 CACNA1SQ13698 1873 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 GLI3P10071 1580 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 KIAA0355O15063 1070 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 FOXK1P85037 733 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 22.3
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NISCH-213ENST00000489895 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 ADAM29Q9UKF5 820 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 TJP1Q07157 1748 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 HSPA12AO43301 675 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 MC3RP41968 323 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 GPR4P46093 362 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 ELP5Q8TE02 316 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 PGAM5Q96HS1 289 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 PRKYO43930 277 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 RDH16O75452 317 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 SOX2P48431 317 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 HERV-K104P61576 105 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 HSD11B2P80365 405 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 GXYLT1Q4G148 440 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 OR9A2Q8NGT5 310 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 OR5K2Q8NHB8 316 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 PROKR1Q8TCW9 393 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 FUZQ9BT04 418 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
NISCH-213ENST00000489895 PYCR1P32322 319 aa16.13■□□□□ 0.17
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