RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561212.5

ZEB1-222, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, human

TSL 5

Gene ZEB1, Length 1,500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB1-222	ENST00000561212	TP53BP2	Q13625	1128 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	GNA13	Q14344	377 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	NEDD8	Q15843	81 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	MICA	Q29983	383 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	RNF44	Q7L0R7	432 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	ASPG	Q86U10	573 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	TRIM73	Q86UV7	250 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	C11orf74	Q86VG3	221 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	GKN2	Q86XP6	184 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	LGI4	Q8N135	537 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	PARP8	Q8N3A8	854 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	SLC5A8	Q8N695	610 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	SMYD1	Q8NB12	490 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	LMX1A	Q8TE12	382 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	RSC1A1	Q92681	617 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	PROX1	Q92786	737 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	MUL1	Q969V5	352 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	BBS4	Q96RK4	519 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	NODAL	Q96S42	347 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	FEV	Q99581	238 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	RAB33B	Q9H082	229 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	DUSP21	Q9H596	190 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	FANCE	Q9HB96	536 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	RP1	P56715	2156 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212		H3BMQ9	156 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	PGRMC2	O15173	223 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	HCRTR1	O43613	425 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	ASNA1	O43681	348 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	SLC28A2	O43868	658 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	SH3BP5	O60239	455 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	SERPINB7	O75635	380 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	NR2F6	P10588	404 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	PCMT1	P22061	227 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	CBL	P22681	906 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	EPHA2	P29317	976 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	GPC1	P35052	558 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	GGT2	P36268	569 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	KCNJ5	P48544	419 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	CDH12	P55289	794 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	SLC35A2	P78381	396 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	PRR5	P85299	388 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	BNIP3	Q12983	259 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	DUSP7	Q16829	419 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	COLEC12	Q5KU26	742 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	GPR107	Q5VW38	600 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	MLIP	Q5VWP3	458 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	KRT73	Q86Y46	540 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	AVL9	Q8NBF6	648 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	BBS10	Q8TAM1	723 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	UCN3	Q969E3	161 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	COG8	Q96MW5	612 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	ZNF681	Q96N22	645 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZEB1-222	ENST00000561212	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		6.97	□□□□□ -1.29

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