RNA–Protein interactions for RNA: YMR287C

DSS1, Transcript of 3'-5' exoribonuclease, yeast

Gene DSS1, Length 2,910 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS1	YMR287C	BOI2	P39969	1040 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	PRY1	P47032	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	YOL057W	Q08225	711 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	TMA17	Q12513	150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	TRK2	P28584	889 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	YBR071W	P38243	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	YAP1801	P38856	637 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	SFL1	P20134	766 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	EUG1	P32474	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
DSS1	YMR287C	FUN30	P31380	1131 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	TNA1	P53322	534 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	RSC58	Q07979	502 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	ADE8	P04161	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	PMT3	P47190	753 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	HDA1	P53973	706 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	ATG33	Q06485	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DSS1	YMR287C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	YRO2	P38079	344 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	YGR035C	P53222	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	AI1	P03875	834 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	PIF1	P07271	859 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	ORC3	P54790	616 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	RIP-Chip
DSS1	YMR287C	MET7	Q08645	548 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	YCL002C	P25565	263 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	SDH1	Q00711	640 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	MSC2	Q03455	724 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	HXT7	P39004	570 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	THI21	Q08975	551 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	HOG1	P32485	435 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	YJR096W	P47137	282 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	TOP1	P04786	769 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	YER158C	P40095	573 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	PPH3	P32345	308 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	YHL012W	P38709	493 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	TPM2	P40414	161 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	MMM1	P41800	426 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	HMG1	P12683	1054 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	PLC1	P32383	869 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	SWE1	P32944	819 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	MDL2	P33311	773 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	DSS1	P39112	969 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	CDA1	Q06702	301 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	SAF1	P38352	637 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	NIT2	P47016	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	TAD1	P53065	400 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	YNL034W	P53963	612 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	YNL018C	P53976	612 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	ARP4	P80428	489 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	MCA1	Q08601	432 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	IES5	P40060	125 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	AIM14	P53109	570 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	DAM1	P53267	343 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	ECM9	Q02202	377 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	COG8	Q04632	607 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	RAD18	P10862	487 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	RSC6	P25632	483 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	ATG14	P38270	344 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	CIT3	P43635	486 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	YNR014W	P53719	212 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	CDC6	P09119	513 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	SFP1	P32432	683 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	CKB2	P38930	258 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	HLJ1	P48353	224 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	DCS2	Q12123	353 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	TPO2	P53283	614 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	YPL062W	Q02781	134 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	THI72	Q08579	599 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	PHM7	Q12252	991 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	STE13	P33894	931 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSS1	YMR287C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64

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