RNA–Protein interactions for RNA: YMR183C

SSO2, Transcript of Plasma membrane t-SNARE, yeast

Gene SSO2, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSO2	YMR183C	UBX5	Q06682	500 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	HMI1	Q12039	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	EMC1	P25574	760 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	CTS1	P29029	562 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	FUN30	P31380	1131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	MRP8	P35719	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	GIC1	P38785	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
SSO2	YMR183C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
SSO2	YMR183C	ALG12	P53730	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	ENA1	P13587	1091 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	POA1	P38218	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	PBY1	P38254	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	IOC3	P43596	787 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	GCV2	P49095	1034 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	YML122C	Q03207	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	TPO1	Q07824	586 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	CIT2	P08679	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	STE11	P23561	717 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	LST4	P34239	828 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	MET12	P46151	657 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	YAP6	Q03935	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	ADY3	Q07732	790 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO2	YMR183C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	RPC82	P32349	654 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	IRR1	P40541	1150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	GYP7	P48365	746 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	YGR012W	P53206	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	CDA1	Q06702	301 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	HIS5	P07172	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	HSF1	P10961	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	NPP2	P39997	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	YJL049W	P47048	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	NSE3	Q05541	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	TMA10	Q06177	86 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	PPH3	P32345	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	SRP101	P32916	621 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	STE5	P32917	917 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	CHA4	P43634	648 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	SPE1	P08432	466 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	CCC2	P38995	1004 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	PLB1	P39105	664 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	YER158C	P40095	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	TPO2	P53283	614 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	SFB2	P53953	876 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	RPN4	Q03465	531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	ADE8	P04161	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
SSO2	YMR183C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	ATG19	P35193	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
SSO2	YMR183C	YBR184W	P38299	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	SIT1	P39980	628 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	HCM1	P25364	564 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
SSO2	YMR183C	DCG1	P32460	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	SCT1	P32784	759 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	AFR1	P33304	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	YRO2	P38079	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
SSO2	YMR183C	YKE2	P52553	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	FMP25	Q08023	583 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	YOL057W	Q08225	711 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSO2	YMR183C	NPP1	P25353	742 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSO2	YMR183C	GRX4	P32642	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSO2	YMR183C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SSO2	YMR183C	TRM2	P33753	639 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSO2	YMR183C	TPM2	P40414	161 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSO2	YMR183C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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