RNA–Protein interactions for RNA: YLR197W

NOP56, Transcript of Essential evolutionarily-conserved nucleolar protein, yeast

Gene NOP56, Length 1,515 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NOP56	YLR197W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	MEF2	P39677	819 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	BUD6	P41697	788 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	CDA2	Q06703	312 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	PPM2	Q08282	695 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	TOP3	P13099	656 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	PET10	P36139	283 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	ERT1	P38140	529 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
NOP56	YLR197W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	YER158C	P40095	573 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	TOK1	P40310	691 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	NIT1	P40447	199 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	GAL11	P19659	1081 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	RNQ1	P25367	405 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	DOM34	P33309	386 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	REC104	P33323	182 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	BET3	P36149	193 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	YKE2	P52553	114 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	RTA1	P53047	317 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	AIM44	Q99299	758 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	RPC82	P32349	654 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	ELM1	P32801	640 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NOP56	YLR197W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	CIT2	P08679	460 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	ENA1	P13587	1091 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	MND2	P40577	368 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	YGR012W	P53206	393 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	GCN5	Q03330	439 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	DUS4	Q06063	367 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	SOD2	P00447	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	CDA1	Q06702	301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	HSF1	P10961	833 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	TIM23	P32897	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	SRP101	P32916	621 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	NUP82	P40368	713 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	OSW7	P43611	510 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	GCV2	P49095	1034 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	GPB1	Q08886	897 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	CDC6	P09119	513 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	SPT20	P50875	604 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	RIM8	P53179	542 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	RXT3	Q07458	294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	TPO1	Q07824	586 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	THI80	P35202	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	POA1	P38218	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	TOD6	P34219	525 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	UBP5	P39944	805 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	MET12	P46151	657 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	VPS62	P53285	467 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	ADY3	Q07732	790 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	PHO8	P11491	566 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	CDC20	P26309	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	STE13	P33894	931 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	IRC24	P40580	263 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	ENV7	Q12003	364 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	HMI1	Q12039	706 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
NOP56	YLR197W	HIS5	P07172	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	SPE1	P08432	466 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	EMC1	P25574	760 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	GDH3	P39708	457 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	ALG2	P43636	503 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	RNH70	P53331	553 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NOP56	YLR197W	ATG19	P35193	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NOP56	YLR197W	GYP8	P43570	497 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NOP56	YLR197W	CHA4	P43634	648 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NOP56	YLR197W	NIT3	P49954	291 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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