RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W BI4P03879 638 aa5.81□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W PRP19P32523 503 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W SWE1P32944 819 aa5.81□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W MDJ1P35191 511 aa5.81□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W YKR078WP36158 585 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W YBR071WP38243 211 aa5.81□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W YER158CP40095 573 aa5.81□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W TY4A-JP47023 414 aa5.81□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W YJR096WP47137 282 aa5.81□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W ALT1P52893 592 aa5.81□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W SND1Q04007 877 aa5.81□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W GUD1Q07729 489 aa5.81□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W PER1P25625 357 aa5.8□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W CDC48P25694 835 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W DAS1P47005 663 aa5.8□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W PEX14P53112 341 aa5.8□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W EAR1Q03212 550 aa5.8□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W COG8Q04632 607 aa5.8□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W GAS5Q08193 484 aa5.8□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W DPH6Q12429 685 aa5.8□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W GAR1P28007 205 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W MCD4P36051 919 aa5.79□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W CCZ1P38273 704 aa5.79□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W PCM1P38628 557 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W GIC1P38785 314 aa5.79□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W NPP2P39997 493 aa5.79□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W YPR196WQ06595 470 aa5.79□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W YOR378WQ08902 515 aa5.79□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W NYV1Q12255 253 aa5.79□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W MPH2P0CD99 609 aa5.78□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W HOG1P32485 435 aa5.78□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W CKB2P38930 258 aa5.78□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W PIK1P39104 1066 aa5.78□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W BOI2P39969 1040 aa5.78□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W MTC3P53077 123 aa5.78□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W AIM14P53109 570 aa5.78□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W YNR014WP53719 212 aa5.78□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W SRT1Q03175 343 aa5.78□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W ATG33Q06485 197 aa5.78□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W REH1Q06709 432 aa5.78□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W GIN4Q12263 1142 aa5.78□□□□□ -1.48
YKR047WYKR047W HMG1P12683 1054 aa5.77□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W RSC6P25632 483 aa5.77□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W FUN30P31380 1131 aa5.77□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W SFA1P32771 386 aa5.77□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W YHL012WP38709 493 aa5.77□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W YKE2P52553 114 aa5.77□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W SFB2P53953 876 aa5.77□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W HPF1Q05164 967 aa5.77□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W YDL176WQ12027 708 aa5.77□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W RFA1P22336 621 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W PLC1P32383 869 aa5.76□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W TFC4P33339 1025 aa5.76□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W RPN10P38886 268 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W DOT6P40059 670 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W RRT14P40470 206 aa5.76□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W VPS72Q03388 795 aa5.76□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W RSB1Q08417 382 aa5.76□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W GUP2Q08929 609 aa5.76□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W ATP4P05626 244 aa5.75□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W DAL7P21826 554 aa5.75□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W HIR1P32479 840 aa5.75□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W PEA2P40091 420 aa5.75□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W ALY2P47029 1046 aa5.75□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W BUD9P53226 547 aa5.75□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W NHX1Q04121 633 aa5.75□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W OSW2Q12202 724 aa5.75□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W MPD2Q99316 277 aa5.75□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W KAR1P11927 433 aa5.74□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W ACE2P21192 770 aa5.74□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W SRO9P25567 434 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W PWP2P25635 923 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W VPS24P36095 224 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W SBE2P42223 864 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W GZF3P42944 551 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W DUG1P43616 481 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W TAD1P53065 400 aa5.74□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W YGR035CP53222 116 aa5.74□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W NOG2P53742 486 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W YNL034WP53963 612 aa5.74□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W YNL018CP53976 612 aa5.74□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W TGL2P54857 326 aa5.74□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W VMS1Q04311 632 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W YVC1Q12324 675 aa5.74□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W SST2P11972 698 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W SAM35P14693 329 aa5.73□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W AEP2P22136 580 aa5.73□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W MDL2P33311 773 aa5.73□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data5.73□□□□□ -1.49not detected
YKR047WYKR047W SDH1Q00711 640 aa5.73□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W SVS1Q12254 260 aa5.73□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W AI1P03875 834 aa5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.6 ms