RNA–Protein interactions for RNA: YBR293W

VBA2, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA2, Length 1,425 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA2	YBR293W	FMP30	Q02883	468 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	BUD3	P25558	1636 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	USO1	P25386	1790 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	FAR1	P21268	830 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	RDS1	P25611	832 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	NPL6	P32832	435 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	PET112	P33893	541 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	NTH2	P35172	780 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	ATG14	P38270	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YAP3	P38749	330 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	ERP5	P38819	212 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SYG1	P40528	902 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	INA22	P40576	216 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	CNS1	P33313	385 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	VPS35	P34110	944 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	OCA5	P38738	679 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TDA11	P38854	504 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	KTR7	P40504	517 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	MDJ2	P42834	146 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	STB1	P42845	420 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	DAS1	P47005	663 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	CTF18	P49956	741 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	ADA2	Q02336	434 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	PLP1	Q04004	230 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	CSI1	Q04368	295 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SPC24	Q04477	213 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	VPS38	Q05919	439 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	THI72	Q08579	599 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	NUR1	Q12066	484 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	IES3	Q12345	250 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	AI1	P03875	834 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	PET122	P10355	254 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	RIB7	P33312	244 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	MDJ1	P35191	511 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SAP185	P40856	1058 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	NSG2	P53898	299 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	BOP3	P53958	396 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	GTR1	Q00582	310 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TAF8	Q03750	510 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YML108W	Q03759	105 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	BUD7	Q08754	746 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	OCA6	Q12454	224 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TSC13	Q99190	310 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	PHO13	P19881	312 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	RAD53	P22216	821 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	HSP78	P33416	811 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SQT1	P35184	431 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	MRP8	P35719	219 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	HSM3	P38348	480 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	REV7	P38927	245 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	AIM21	P40563	679 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	MAD1	P40957	749 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	GYP7	P48365	746 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	ERP6	P53198	216 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YNL144C	P53907	740 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SFB2	P53953	876 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected

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