RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	YHL017W	P38745	532 aa		6.01	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	ATG19	P35193	415 aa		6	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	ERG5	P54781	538 aa		6	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	ARO10	Q06408	635 aa		5.99	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	MCM7	P38132	845 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	PNT1	P38969	423 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	THI12	P42883	340 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	THI5	P43534	340 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	THI11	P47183	340 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	THI13	Q07748	340 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	UPC2	Q12151	913 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	WHI5	Q12416	295 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	YUR1	P26725	428 aa		5.97	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
VAR1	Q0140	FRE5	Q08908	694 aa		5.96	□□□□□ -1.46
VAR1	Q0140	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
VAR1	Q0140	MRL1	Q06815	381 aa		5.95	□□□□□ -1.46
VAR1	Q0140	DAS1	P47005	663 aa		5.94	□□□□□ -1.46
VAR1	Q0140	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
VAR1	Q0140	MCD1	Q12158	566 aa		5.94	□□□□□ -1.46
VAR1	Q0140	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
VAR1	Q0140	MRPS18	P42847	217 aa		5.92	□□□□□ -1.46
VAR1	Q0140	GAT1	P43574	510 aa		5.92	□□□□□ -1.46
VAR1	Q0140	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
VAR1	Q0140	STE14	P32584	239 aa		5.91	□□□□□ -1.46
VAR1	Q0140	ADY2	P25613	283 aa		5.9	□□□□□ -1.46
VAR1	Q0140	SEC20	P28791	383 aa		5.9	□□□□□ -1.46
VAR1	Q0140	YGR122W	P53272	402 aa		5.9	□□□□□ -1.46
VAR1	Q0140	RGT1	P32862	1170 aa		5.89	□□□□□ -1.47
VAR1	Q0140	MDM38	Q08179	573 aa		5.89	□□□□□ -1.47
VAR1	Q0140	YKL151C	P36059	337 aa		5.88	□□□□□ -1.47
VAR1	Q0140	SRT1	Q03175	343 aa		5.88	□□□□□ -1.47
VAR1	Q0140	SED4	P25365	1065 aa		5.87	□□□□□ -1.47
VAR1	Q0140	GCR1	P07261	785 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VAR1	Q0140	RAD2	P07276	1031 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VAR1	Q0140	RER2	P35196	286 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VAR1	Q0140	GIC1	P38785	314 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VAR1	Q0140	IPL1	P38991	367 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VAR1	Q0140	YIL166C	P40445	542 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VAR1	Q0140	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VAR1	Q0140	CDC43	P18898	376 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VAR1	Q0140	FUN30	P31380	1131 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VAR1	Q0140	ADY4	Q05955	493 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VAR1	Q0140	CYC8	P14922	966 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VAR1	Q0140	PUS2	P53167	370 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VAR1	Q0140	YLL058W	Q12198	575 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VAR1	Q0140	ELO3	P40319	345 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VAR1	Q0140	KIN3	P22209	435 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VAR1	Q0140	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
VAR1	Q0140	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
VAR1	Q0140	MET3	P08536	511 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VAR1	Q0140	PCL5	P38794	229 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VAR1	Q0140	NPP2	P39997	493 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VAR1	Q0140	DLT1	Q04216	342 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VAR1	Q0140	PEX19	Q07418	342 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VAR1	Q0140	STB2	P46679	850 aa		5.78	□□□□□ -1.48
VAR1	Q0140	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
VAR1	Q0140	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
VAR1	Q0140	SLD2	P34252	453 aa		5.76	□□□□□ -1.49
VAR1	Q0140	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
VAR1	Q0140	SFB2	P53953	876 aa		5.76	□□□□□ -1.49
VAR1	Q0140	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
VAR1	Q0140	CTF13	P35203	478 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VAR1	Q0140	MGE1	P38523	228 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VAR1	Q0140	RAD27	P26793	382 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VAR1	Q0140	MCM2	P29469	868 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VAR1	Q0140	ORC2	P32833	620 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VAR1	Q0140	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VAR1	Q0140	TDA9	Q04545	1251 aa		5.71	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	RTT10	Q08924	1013 aa		5.71	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	YPL066W	Q12194	479 aa		5.71	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	POL32	P47110	350 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	RIM13	Q03792	727 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	SPR28	Q04921	423 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	YJR107W	P47145	328 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	MUP1	P50276	574 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	RGT2	Q12300	763 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	TRM11	Q12463	433 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	ATE1	P16639	503 aa		5.66	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	FYV10	P40492	516 aa		5.66	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	CRR1	Q05790	422 aa		5.66	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	SPO11	P23179	398 aa		5.65	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	YJL163C	P46996	555 aa		5.65	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	RIA1	P53893	1110 aa		5.65	□□□□□ -1.5
VAR1	Q0140	RPC82	P32349	654 aa		5.64	□□□□□ -1.51
VAR1	Q0140	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
VAR1	Q0140	FKH2	P41813	862 aa		5.64	□□□□□ -1.51

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