RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619314.1

GABPB1-AS1-206, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

Gene GABPB1-AS1, Length 1,076 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa29.08■■■□□ 2.25
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 C10orf71Q711Q0 1435 aa29.08■■■□□ 2.25
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 BCORQ6W2J9 1755 aa29.08■■■□□ 2.25
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 NLGN2Q8NFZ4 835 aa29.07■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 MYH16Q9H6N6 1097 aa29.07■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 NECTIN2Q92692 538 aa29.06■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CARMIL3Q8ND23 1372 aa29.05■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 GOLGA2Q08379 1002 aa29.05■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PROSER3Q2NL68 480 aa29.05■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 BICDL1Q6ZP65 573 aa29.05■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TTLL7Q6ZT98 887 aa29.05■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 HYPKQ9NX55 129 aa29.05■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CHPF2Q9P2E5 772 aa29.05■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 KIF13BQ9NQT8 1826 aa29.04■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.04■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 GPR162Q16538 588 aa29.04■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CCDC30Q5VVM6 783 aa29.04■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 HLFQ16534 295 aa29.03■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 COPS6Q7L5N1 327 aa29.02■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 NRXN2Q9P2S2 1712 aa29.02■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 ANXA1P04083 346 aa29.01■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TSPYL6Q8N831 410 aa29.01■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.01■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 ATP10DQ9P241 1426 aa28.99■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.98■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.98■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.97■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 E9PSI1 815 aa28.96■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PRR5LQ6MZQ0 368 aa28.96■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.96■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.96■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.95■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.95■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CNBD1Q8NA66 436 aa28.95■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.95■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 BRIP1Q9BX63 1249 aa28.95■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 VAMP4O75379 141 aa28.94■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 ST5P78524 1137 aa28.94■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 STK31Q9BXU1 1019 aa28.94■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 NYXQ9GZU5 481 aa28.94■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 NUP98P52948 1817 aa28.94■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 A0A0G2JLW4 131 aa28.93■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 DPEP1P16444 411 aa28.93■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PARP10Q53GL7 1025 aa28.93■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 NPHP1O15259 732 aa28.92■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 GRIN3BO60391 1043 aa28.92■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PDE6BP35913 854 aa28.92■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 SLFN5Q08AF3 891 aa28.91■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TCIRG1Q13488 830 aa28.91■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 KCNA3P22001 575 aa28.9■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa28.9■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.89■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PIM2Q9P1W9 311 aa28.89■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 H0YIN7 160 aa28.87■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.87■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 SLC4A2P04920 1241 aa28.86■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 GPTP24298 496 aa28.86■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 SUSD4Q5VX71 490 aa28.86■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.86■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CHRNA5P30532 468 aa28.85■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.85■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 C2CD5Q86YS7 1000 aa28.85■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 NLRP10Q86W26 655 aa28.83■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.83■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 FAM177BA6PVY3 158 aa28.82■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 NTSR2O95665 410 aa28.82■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CCDC24Q8N4L8 307 aa28.82■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 ZNF428Q96B54 188 aa28.82■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CACNA1FO60840 1977 aa28.82■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 RIC1Q4ADV7 1423 aa28.81■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 KSR2Q6VAB6 950 aa28.81■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.81■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 BCS1LQ9Y276 419 aa28.81■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa28.8■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 SRGNP10124 158 aa28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms