RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 GRM8O00222 908 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-212ENST00000591041 A1BGP04217 495 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-212ENST00000591041 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-212ENST00000591041 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-212ENST00000591041 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-212ENST00000591041 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-212ENST00000591041 MYD88Q99836 296 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-212ENST00000591041 PALLDQ8WX93 1383 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD45Q5TZF3 282 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 NBPF26B4DH59 902 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 NBPF14Q5TI25 921 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 SIRT2Q8IXJ6 389 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 NBPF15Q8N660 670 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 UTYO14607 1347 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP6V1AP38606 617 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 SIK1P57059 783 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 GCKRQ14397 625 aa28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB11FIP3O75154 756 aa28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM161AQ3B820 660 aa28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-212ENST00000591041 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.07■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 BAG6P46379 1132 aa28.07■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC191Q8NCU4 936 aa28.07■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC87Q9NVE4 849 aa28.07■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A087WZG4 1122 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 MTX1Q13505 466 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 SSH3Q8TE77 659 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 NHSQ6T4R5 1651 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 COL15A1P39059 1388 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 LRP5O75197 1615 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 SRGAP3O43295 1099 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV5-2P06315 115 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 ARXQ96QS3 562 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 LNPKQ9C0E8 428 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 PDE4AP27815 886 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 ERC1Q8IUD2 1116 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 TJP1Q07157 1748 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-212ENST00000591041 TCIRG1Q13488 830 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 POLA2Q14181 598 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 NUP188Q5SRE5 1749 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNQ2O43526 872 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 CRKLP46109 303 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC4A9Q96Q91 983 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 BACH2Q9BYV9 841 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 RGL2O15211 777 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF1BPQ96EK5 621 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 ISCA1Q9BUE6 129 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 SUCLG2Q96I99 432 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 H7C1W4 665 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 BTAF1O14981 1849 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 RREB1Q92766 1687 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.061e-7■■■■■ 27.3
CAPNS1-212ENST00000591041 BMP2KLQ5H9B9 411 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms