RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589923.1

GRN-216, Transcript of granulin precursor, humanhuman

TSL 2

Gene GRN, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRN-216ENST00000589923 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.73□□□□□ -0.05
GRN-216ENST00000589923 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
GRN-216ENST00000589923 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.72□□□□□ -0.05
GRN-216ENST00000589923 STYK1Q6J9G0 422 aa14.72□□□□□ -0.05
GRN-216ENST00000589923 OLFM4Q6UX06 510 aa14.72□□□□□ -0.05
GRN-216ENST00000589923 SNED1Q8TER0 1413 aa14.72□□□□□ -0.05
GRN-216ENST00000589923 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.71□□□□□ -0.05
GRN-216ENST00000589923 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
GRN-216ENST00000589923 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
GRN-216ENST00000589923 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
GRN-216ENST00000589923 COL4A5P29400 1685 aa14.71□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 LTBP1Q14766 1721 aa14.7□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 CNKSR1Q969H4 720 aa14.7□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 MASTLQ96GX5 879 aa14.7□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 SETDB2Q96T68 719 aa14.7□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.69□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 VEGFBP49765 207 aa14.69□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 TEFQ10587 303 aa14.69□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 LDHDQ86WU2 507 aa14.69□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 THSD7BQ9C0I4 1608 aa14.69□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 ST5P78524 1137 aa14.68□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.68□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.68□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.68□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 USP16Q9Y5T5 823 aa14.68□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.67□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.67□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.66□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.66□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 CCDC93Q567U6 631 aa14.66□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 SOGA3Q5TF21 947 aa14.66□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 SLC51AQ86UW1 340 aa14.66□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 WBP1LQ9NX94 342 aa14.66□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.65□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 NBPF26B4DH59 902 aa14.65□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 NBPF15Q8N660 670 aa14.65□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.65□□□□□ -0.06
GRN-216ENST00000589923 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.64□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 BTBD11A6QL63 1104 aa14.64□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 NPR1P16066 1061 aa14.64□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.64□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 ABCC12Q96J65 1359 aa14.63□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 RASSF10A6NK89 507 aa14.63□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 FZD9O00144 591 aa14.63□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 NPHP1O15259 732 aa14.63□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 EPHX2P34913 555 aa14.63□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 LBX1P52954 281 aa14.63□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.63□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 HACL1Q9UJ83 578 aa14.63□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 PRKAR2BP31323 418 aa14.62□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 NUP98P52948 1817 aa14.62□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.071e-8■□□□□ 10.8
GRN-216ENST00000589923 HLFQ16534 295 aa14.61□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.6□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 MCM10Q7L590 875 aa14.6□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 CNTROBQ8N137 903 aa14.6□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 FAM177BA6PVY3 158 aa14.59□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 CRY2Q49AN0 593 aa14.59□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.59□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 SYNE4Q8N205 404 aa14.59□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 AIDAQ96BJ3 306 aa14.59□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.59□□□□□ -0.07
GRN-216ENST00000589923 RGL2O15211 777 aa14.58□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 DCTN1Q14203 1278 aa14.58□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.58□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.58□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 GPC2Q8N158 579 aa14.58□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 ABHD8Q96I13 439 aa14.58□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.58□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.58□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.58□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.58□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 SLC34A2O95436 690 aa14.57□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 SCNN1DP51172 638 aa14.57□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 PSMD1Q99460 953 aa14.57□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.56□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 EPS15P42566 896 aa14.55□□□□□ -0.08
GRN-216ENST00000589923 FAM161AQ3B820 660 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms