RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 NEXNQ0ZGT2 675 aa35.27■■■■□ 3.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 EP400Q96L91 3159 aa35.24■■■■□ 3.23
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CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNQ2O43526 872 aa35.23■■■■□ 3.23
CTDNEP1-210ENST00000574322 ASAP1Q9ULH1 1129 aa35.23■■■■□ 3.23
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CTDNEP1-210ENST00000574322 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRRCC1Q9C099 1032 aa35.22■■■■□ 3.23
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CTDNEP1-210ENST00000574322 RAB11FIP3O75154 756 aa35.21■■■■□ 3.23
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DDRGK1Q96HY6 314 aa35.21■■■■□ 3.23
CTDNEP1-210ENST00000574322 OSBPL3Q9H4L5 887 aa35.21■■■■□ 3.23
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MYD88Q99836 296 aa35.18■■■■□ 3.22
CTDNEP1-210ENST00000574322 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
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CTDNEP1-210ENST00000574322 A1BGP04217 495 aa35.18■■■■□ 3.22
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTF1AQ7RTS3 328 aa35.18■■■■□ 3.22
CTDNEP1-210ENST00000574322 COL15A1P39059 1388 aa35.17■■■■□ 3.22
CTDNEP1-210ENST00000574322 SALL3Q9BXA9 1300 aa35.17■■■■□ 3.22
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CTDNEP1-210ENST00000574322 C22orf23Q9BZE7 217 aa35■■■■□ 3.19
CTDNEP1-210ENST00000574322 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
CTDNEP1-210ENST00000574322 PALLDQ8WX93 1383 aa35■■■■□ 3.19
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CTDNEP1-210ENST00000574322 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP34.98■■■■□ 3.19
CTDNEP1-210ENST00000574322 ISCA1Q9BUE6 129 aa34.98■■■■□ 3.19
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