RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 RLBP1P12271 317 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 AK7Q96M32 723 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 NUP98P52948 1817 aa23.75■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.75■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 PANK1Q8TE04 598 aa23.75■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 AKT1S1Q96B36 256 aa23.75■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 COL15A1P39059 1388 aa23.75■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 F6X3S4 739 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 GNPATO15228 680 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 ADRA2BP18089 450 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 RGL2O15211 777 aa23.73■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 NEFLP07196 543 aa23.73■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 ATP10DQ9P241 1426 aa23.73■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.72■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 BCORQ6W2J9 1755 aa23.72■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 SSFA2P28290 1259 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.7■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 C4AP0C0L4 1744 aa23.7■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.7■■□□□ 1.39
SPNS1-210ENST00000568388 BEND3Q5T5X7 828 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 LINS1Q8NG48 757 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 NARFQ9UHQ1 456 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 COG6Q9Y2V7 657 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 ALDH1L1O75891 902 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 CAMTA2O94983 1202 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF827Q17R98 1081 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 CRBNQ96SW2 442 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 SPON1Q9HCB6 807 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 STK32BQ9NY57 414 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.68■■□□□ 1.38
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SPNS1-210ENST00000568388 TCIRG1Q13488 830 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 SLC15A2Q16348 729 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 ARXQ96QS3 562 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 HLFQ16534 295 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 MYD88Q99836 296 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 IGKV5-2P06315 115 aa23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-210ENST00000568388 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 RFC4P35249 363 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 AAMPQ13685 434 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 SMIM5Q71RC9 77 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 ZPR1O75312 459 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 FKBP8Q14318 412 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 PHF14O94880 888 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 ZBTB7AO95365 584 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 GCKRQ14397 625 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 USP44Q9H0E7 712 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-210ENST00000568388 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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