RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 NGEFQ8N5V2 710 aa27.61■■■□□ 2.01
PPP4C-211ENST00000567642 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
PPP4C-211ENST00000567642 NMRK2Q9NPI5 230 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4C-211ENST00000567642 NUP98P52948 1817 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4C-211ENST00000567642 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.58■■■□□ 2.01
PPP4C-211ENST00000567642 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
PPP4C-211ENST00000567642 FAM177BA6PVY3 158 aa27.57■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.57■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.57■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 SLX4Q8IY92 1834 aa27.56■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 C21orf2O43822 256 aa27.55■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 LMNB1P20700 586 aa27.55■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.55■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.55■■■□□ 21e-7■■□□□ 13.3
PPP4C-211ENST00000567642 HLFQ16534 295 aa27.55■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 KDM2BQ8NHM5 1336 aa27.55■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa27.55■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 MYL6BP14649 208 aa27.54■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 NEUROD2Q15784 382 aa27.54■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa27.54■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 TIAM2Q8IVF5 1701 aa27.54■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 RGL2O15211 777 aa27.53■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 HSPA6P17066 643 aa27.53■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.53■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 CNKSR1Q969H4 720 aa27.53■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 TOMM70O94826 608 aa27.52■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 STYK1Q6J9G0 422 aa27.52■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 KIF6Q6ZMV9 814 aa27.52■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 MASTLQ96GX5 879 aa27.52■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP27.51■■■□□ 2
PPP4C-211ENST00000567642 NFKBIEO00221 500 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 SRGNP10124 158 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 PRELPP51888 382 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 TTLL7Q6ZT98 887 aa27.5■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 RRAGCQ9HB90 399 aa27.5■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa27.49■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 RUNDC1Q96C34 613 aa27.49■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 ERVV-1B6SEH8 477 aa27.48■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 ZBTB3Q9H5J0 574 aa27.47■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 BABAM1Q9NWV8 329 aa27.47■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.46■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 ERBB4Q15303 1308 aa27.45■■□□□ 1.99
PPP4C-211ENST00000567642 NPR1P16066 1061 aa27.45■■□□□ 1.98
PPP4C-211ENST00000567642 GPTP24298 496 aa27.44■■□□□ 1.98
PPP4C-211ENST00000567642 NYXQ9GZU5 481 aa27.44■■□□□ 1.98
PPP4C-211ENST00000567642 GLTPD2A6NH11 291 aa27.43■■□□□ 1.98
PPP4C-211ENST00000567642 SOGA3Q5TF21 947 aa27.43■■□□□ 1.98
PPP4C-211ENST00000567642 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
PPP4C-211ENST00000567642 TAOK3Q9H2K8 898 aa27.43■■□□□ 1.98
PPP4C-211ENST00000567642 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.42■■□□□ 1.98
PPP4C-211ENST00000567642 NECTIN2Q92692 538 aa27.42■■□□□ 1.98
PPP4C-211ENST00000567642 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
PPP4C-211ENST00000567642 ERFEQ4G0M1 354 aa27.41■■□□□ 1.98
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.41■■□□□ 1.98
PPP4C-211ENST00000567642 ANXA1P04083 346 aa27.4■■□□□ 1.98
PPP4C-211ENST00000567642 DPY19L2Q6NUT2 758 aa27.39■■□□□ 1.98
PPP4C-211ENST00000567642 LTBP3Q9NS15 1303 aa27.39■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 ABCC12Q96J65 1359 aa27.38■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 CEP350Q5VT06 3117 aa27.38■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 APLP1P51693 650 aa27.38■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 PDIA6Q15084 440 aa27.38■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 PROSER3Q2NL68 480 aa27.38■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC93Q567U6 631 aa27.38■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.38■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 CHL1O00533 1208 aa27.37■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 ALDH1B1P30837 517 aa27.37■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 SUSD4Q5VX71 490 aa27.37■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 C7orf43Q8WVR3 580 aa27.37■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa27.36■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 KRT24Q2M2I5 525 aa27.36■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.36■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 FSTL1Q12841 308 aa27.35■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 LRP10Q7Z4F1 713 aa27.35■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 OLFM4Q6UX06 510 aa27.34■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.34■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 WDR90Q96KV7 1748 aa27.33■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 COPS6Q7L5N1 327 aa27.33■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
PPP4C-211ENST00000567642 PARP10Q53GL7 1025 aa27.32■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.32■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 NTSR2O95665 410 aa27.31■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 CRY2Q49AN0 593 aa27.31■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 SMC1BQ8NDV3 1235 aa27.31■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 APAF1O14727 1248 aa27.3■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 RTKN2Q8IZC4 609 aa27.3■■□□□ 1.96
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