RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 NFIXQ14938 502 aa27.01■■□□□ 1.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF6Q6ZMV9 814 aa27.01■■□□□ 1.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 COPS6Q7L5N1 327 aa27.01■■□□□ 1.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.01■■□□□ 1.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 VAMP4O75379 141 aa27.01■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDR1Q08345 913 aa27.01■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 HLFQ16534 295 aa27.01■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.01■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLHL34Q8N239 644 aa27.01■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa27■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBTB3Q9H5J0 574 aa27■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 PARP3Q9Y6F1 533 aa27■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUP98P52948 1817 aa27■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.99■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 HYPKQ9NX55 129 aa26.99■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.98■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.98■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.97■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 STK31Q9BXU1 1019 aa26.96■■□□□ 1.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 SETDB2Q96T68 719 aa26.94■■□□□ 1.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 RGL2O15211 777 aa26.94■■□□□ 1.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYT17Q9BSW7 474 aa26.94■■□□□ 1.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC4A2P04920 1241 aa26.93■■□□□ 1.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 SERPINB2P05120 415 aa26.93■■□□□ 1.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.92■■□□□ 1.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 CACNA1FO60840 1977 aa26.92■■□□□ 1.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.91■■□□□ 1.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.9■■□□□ 1.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.9■■□□□ 1.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPTP24298 496 aa26.9■■□□□ 1.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 G2E3Q7L622 706 aa26.9■■□□□ 1.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.9■■□□□ 1.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.9■■□□□ 1.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.89■■□□□ 1.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.89■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP10DQ9P241 1426 aa26.88■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.88■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.87■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM177BA6PVY3 158 aa26.87■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.87■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.87■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.86■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.86■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.86■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 NPHP1O15259 732 aa26.84■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCIRG1Q13488 830 aa26.84■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.84■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 FLIIQ13045 1269 aa26.83■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.83■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNBD1Q8NA66 436 aa26.83■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 SUSD4Q5VX71 490 aa26.82■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.81■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.81■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.81■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF428Q96B54 188 aa26.81■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.81■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.81■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.81■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.8■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 KSR2Q6VAB6 950 aa26.8■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.8■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADCY9O60503 1353 aa26.8■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.79■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A0G2JLW4 131 aa26.79■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 PARP10Q53GL7 1025 aa26.79■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 NLRP10Q86W26 655 aa26.79■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.78■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 TGFB2P61812 414 aa26.78■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 ST5P78524 1137 aa26.78■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.78■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYD88Q99836 296 aa26.78■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.78■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.77■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 NYXQ9GZU5 481 aa26.77■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.77■■□□□ 1.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 NTSR2O95665 410 aa26.76■■□□□ 1.87
CCNDBP1-208ENST00000566515 DPEP1P16444 411 aa26.76■■□□□ 1.87
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHRNA5P30532 468 aa26.76■■□□□ 1.87
CCNDBP1-208ENST00000566515 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CCNDBP1-208ENST00000566515 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CCNDBP1-208ENST00000566515 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.76■■□□□ 1.87
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERFEQ4G0M1 354 aa26.76■■□□□ 1.87
CCNDBP1-208ENST00000566515 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CCNDBP1-208ENST00000566515 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.76■■□□□ 1.87
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms