RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561868.1

SPNS1-205, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 441 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-205ENST00000561868 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-205ENST00000561868 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-205ENST00000561868 BCORQ6W2J9 1755 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-205ENST00000561868 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-205ENST00000561868 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-205ENST00000561868 ST5P78524 1137 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-205ENST00000561868 DCTN1Q14203 1278 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-205ENST00000561868 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-205ENST00000561868 CNBD1Q8NA66 436 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-205ENST00000561868 CNKSR1Q969H4 720 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-205ENST00000561868 RUNDC1Q96C34 613 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-205ENST00000561868 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-205ENST00000561868 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
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SPNS1-205ENST00000561868 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 PRELPP51888 382 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 HTRA3P83110 453 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 STYK1Q6J9G0 422 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 C21orf2O43822 256 aa20.62■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 CAMTA2O94983 1202 aa20.62■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 ERFEQ4G0M1 354 aa20.62■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.62■□□□□ 0.89
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SPNS1-205ENST00000561868 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.62■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 CACNA1SQ13698 1873 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 RGL2O15211 777 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 RIPK4P57078 832 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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SPNS1-205ENST00000561868 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 MASTLQ96GX5 879 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 SRGNP10124 158 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 SLX4Q8IY92 1834 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 KCNQ3O43525 872 aa20.58■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SPNS1-205ENST00000561868 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 POTECB2RU33 542 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 SCN4AP35499 1836 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 IQCA1LA6NCM1 817 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 MRS2Q9HD23 443 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 USP16Q9Y5T5 823 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 NPR1P16066 1061 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 CCDC93Q567U6 631 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 CHADLQ6NUI6 762 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
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SPNS1-205ENST00000561868 APAF1O14727 1248 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 CREBZFQ9NS37 354 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS1-205ENST00000561868 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 NEUROD2Q15784 382 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 TNS4Q8IZW8 715 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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SPNS1-205ENST00000561868 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 ALDH1B1P30837 517 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 LDHDQ86WU2 507 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 PCNTO95613 3336 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 CHL1O00533 1208 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 NYXQ9GZU5 481 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SPNS1-205ENST00000561868 NBPF26B4DH59 902 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 CCDC27Q2M243 656 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 NBPF15Q8N660 670 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 NUP98P52948 1817 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 ZNF853P0CG23 659 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 CFAP44Q96MT7 982 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 HACL1Q9UJ83 578 aa20.42■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 PASKQ96RG2 1323 aa20.42■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.42■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
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