RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 CACNA1FO60840 1977 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 GRIN3BO60391 1043 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 ST5P78524 1137 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 GOLGA2Q08379 1002 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP10DQ9P241 1426 aa20.36■□□□□ 0.85
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RABGGTA-205ENST00000558534 NYXQ9GZU5 481 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 CHD4Q14839 1912 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 PDE6BP35913 854 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 STK31Q9BXU1 1019 aa20.35■□□□□ 0.85
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RABGGTA-205ENST00000558534 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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RABGGTA-205ENST00000558534 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 NECTIN2Q92692 538 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 KRT24Q2M2I5 525 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 PARP10Q53GL7 1025 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-205ENST00000558534 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 COPS6Q7L5N1 327 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 H0YIN7 160 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 PIM2Q9P1W9 311 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 E9PSI1 815 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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RABGGTA-205ENST00000558534 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 HLFQ16534 295 aa20.29■□□□□ 0.84
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RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF521Q96K83 1311 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.28■□□□□ 0.84
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RABGGTA-205ENST00000558534 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A0G2JLW4 131 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 ANXA1P04083 346 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-205ENST00000558534 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 TCIRG1Q13488 830 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 BCS1LQ9Y276 419 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 TSPYL6Q8N831 410 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF428Q96B54 188 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 GPTP24298 496 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 TTLL6Q8N841 843 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 CNKSR1Q969H4 720 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 STYK1Q6J9G0 422 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 MASTLQ96GX5 879 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM177BA6PVY3 158 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 VAMP4O75379 141 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 KCNA3P22001 575 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 CHRNA5P30532 468 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 SOGA3Q5TF21 947 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-205ENST00000558534 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC4A2P04920 1241 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 NPR1P16066 1061 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 ALDH1B1P30837 517 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-205ENST00000558534 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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