RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.57■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.56■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.56■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 FAM177BA6PVY3 158 aa28.55■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 RGL2O15211 777 aa28.55■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 C21orf2O43822 256 aa28.55■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 TOMM70O94826 608 aa28.55■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 HSPA6P17066 643 aa28.55■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 CNKSR1Q969H4 720 aa28.55■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 MYL6BP14649 208 aa28.54■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 NEUROD2Q15784 382 aa28.54■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.54■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 BCORQ6W2J9 1755 aa28.54■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 DLEC1Q9Y238 1755 aa28.53■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 HLFQ16534 295 aa28.53■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 STYK1Q6J9G0 422 aa28.53■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.53■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 MASTLQ96GX5 879 aa28.53■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 SRGNP10124 158 aa28.52■■■□□ 2.16
CIPC-208ENST00000557115 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa28.51■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.5■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 NFKBIEO00221 500 aa28.5■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.49■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 RRAGCQ9HB90 399 aa28.49■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.48■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.48■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 RUNDC1Q96C34 613 aa28.48■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.48■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 PRELPP51888 382 aa28.47■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.47■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 NPR1P16066 1061 aa28.46■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 SOGA3Q5TF21 947 aa28.46■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.46■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 ERBB4Q15303 1308 aa28.45■■■□□ 2.15
CIPC-208ENST00000557115 NYXQ9GZU5 481 aa28.45■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.45■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.45■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 SBF1O95248 1867 aa28.44■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 GLTPD2A6NH11 291 aa28.43■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 ERFEQ4G0M1 354 aa28.43■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 GPTP24298 496 aa28.42■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 DPY19L2Q6NUT2 758 aa28.42■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.41■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 APLP1P51693 650 aa28.4■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 NECTIN2Q92692 538 aa28.4■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 LTBP3Q9NS15 1303 aa28.4■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 CCDC93Q567U6 631 aa28.39■■■□□ 2.14
CIPC-208ENST00000557115 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 ALDH1B1P30837 517 aa28.38■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.38■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 SLX4Q8IY92 1834 aa28.37■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 FSTL1Q12841 308 aa28.37■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 CEP350Q5VT06 3117 aa28.37■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 CHL1O00533 1208 aa28.36■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 ANXA1P04083 346 aa28.36■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 PDIA6Q15084 440 aa28.36■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 SUSD4Q5VX71 490 aa28.36■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.36■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 PROSER3Q2NL68 480 aa28.35■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.35■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.35■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 C7orf43Q8WVR3 580 aa28.35■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 ABCC12Q96J65 1359 aa28.35■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 RTKN2Q8IZC4 609 aa28.33■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 SMC1BQ8NDV3 1235 aa28.33■■■□□ 2.13
CIPC-208ENST00000557115 KRT24Q2M2I5 525 aa28.32■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 PARP10Q53GL7 1025 aa28.32■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 COPS6Q7L5N1 327 aa28.32■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.32■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.32■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 CRY2Q49AN0 593 aa28.31■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 OLFM4Q6UX06 510 aa28.31■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 CACNA1SQ13698 1873 aa28.31■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.31■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa28.3■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 NUP98P52948 1817 aa28.3■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.3■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 NTSR2O95665 410 aa28.29■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 APAF1O14727 1248 aa28.28■■■□□ 2.12
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