RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC146Q8IYE0 955 aa42.47■■■■■ 4.39
TTC7B-202ENST00000553948 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
TTC7B-202ENST00000553948 SBF1O95248 1867 aa42.46■■■■■ 4.39
TTC7B-202ENST00000553948 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
TTC7B-202ENST00000553948 NGEFQ8N5V2 710 aa42.44■■■■■ 4.38
TTC7B-202ENST00000553948 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP42.44■■■■■ 4.38
TTC7B-202ENST00000553948 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
TTC7B-202ENST00000553948 KIF3CO14782 793 aa42.43■■■■■ 4.38
TTC7B-202ENST00000553948 RUNDC1Q96C34 613 aa42.43■■■■■ 4.38
TTC7B-202ENST00000553948 BABAM1Q9NWV8 329 aa42.43■■■■■ 4.38
TTC7B-202ENST00000553948 RASSF7Q02833 373 aa42.42■■■■■ 4.38
TTC7B-202ENST00000553948 NEUROD2Q15784 382 aa42.41■■■■■ 4.38
TTC7B-202ENST00000553948 HLFQ16534 295 aa42.41■■■■■ 4.38
TTC7B-202ENST00000553948 MYL6BP14649 208 aa42.39■■■■■ 4.38
TTC7B-202ENST00000553948 TPTE2Q6XPS3 522 aa42.39■■■■■ 4.38
TTC7B-202ENST00000553948 ADAMTS8Q9UP79 889 aa42.39■■■■■ 4.38
TTC7B-202ENST00000553948 ERVV-1B6SEH8 477 aa42.37■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 STYK1Q6J9G0 422 aa42.37■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 KIF6Q6ZMV9 814 aa42.37■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 SRGNP10124 158 aa42.36■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 LMNB1P20700 586 aa42.36■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 CNKSR1Q969H4 720 aa42.36■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 ERBB4Q15303 1308 aa42.36■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 NMRK2Q9NPI5 230 aa42.35■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa42.35■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 MASTLQ96GX5 879 aa42.34■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 FAM177BA6PVY3 158 aa42.33■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 C21orf2O43822 256 aa42.33■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 TTLL7Q6ZT98 887 aa42.33■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 KDM2BQ8NHM5 1336 aa42.33■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 NUP98P52948 1817 aa42.32■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 NFKBIEO00221 500 aa42.32■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
TTC7B-202ENST00000553948 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
TTC7B-202ENST00000553948 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
TTC7B-202ENST00000553948 TRIM35Q9UPQ4 493 aa42.3■■■■■ 4.36
TTC7B-202ENST00000553948 CACNA1SQ13698 1873 aa42.3■■■■■ 4.36
TTC7B-202ENST00000553948 PRELPP51888 382 aa42.29■■■■■ 4.36
TTC7B-202ENST00000553948 SLX4Q8IY92 1834 aa42.28■■■■■ 4.36
TTC7B-202ENST00000553948 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
TTC7B-202ENST00000553948 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
TTC7B-202ENST00000553948 ZBTB3Q9H5J0 574 aa42.28■■■■■ 4.36
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa42.28■■■■■ 4.36
TTC7B-202ENST00000553948 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa42.27■■■■■ 4.36
TTC7B-202ENST00000553948 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
TTC7B-202ENST00000553948 TOMM70O94826 608 aa42.26■■■■■ 4.36
TTC7B-202ENST00000553948 NPR1P16066 1061 aa42.26■■■■■ 4.36
TTC7B-202ENST00000553948 NYXQ9GZU5 481 aa42.26■■■■■ 4.36
TTC7B-202ENST00000553948 CHL1O00533 1208 aa42.25■■■■■ 4.35
TTC7B-202ENST00000553948 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
TTC7B-202ENST00000553948 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa42.25■■■■■ 4.35
TTC7B-202ENST00000553948 HSPA6P17066 643 aa42.24■■■■■ 4.35
TTC7B-202ENST00000553948 PDIA6Q15084 440 aa42.23■■■■■ 4.35
TTC7B-202ENST00000553948 SOGA3Q5TF21 947 aa42.23■■■■■ 4.35
TTC7B-202ENST00000553948 TIAM2Q8IVF5 1701 aa42.22■■■■■ 4.35
TTC7B-202ENST00000553948 LRP10Q7Z4F1 713 aa42.21■■■■■ 4.35
TTC7B-202ENST00000553948 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
TTC7B-202ENST00000553948 GPTP24298 496 aa42.2■■■■■ 4.35
TTC7B-202ENST00000553948 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
TTC7B-202ENST00000553948 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
TTC7B-202ENST00000553948 LTBP3Q9NS15 1303 aa42.2■■■■■ 4.35
TTC7B-202ENST00000553948 PROSER3Q2NL68 480 aa42.18■■■■■ 4.34
TTC7B-202ENST00000553948 NUTM1Q86Y26 1132 aa42.18■■■■■ 4.34
TTC7B-202ENST00000553948 TAOK3Q9H2K8 898 aa42.18■■■■■ 4.34
TTC7B-202ENST00000553948 RRAGCQ9HB90 399 aa42.18■■■■■ 4.34
TTC7B-202ENST00000553948 UBN2Q6ZU65 1347 aa42.18■■■■■ 4.34
TTC7B-202ENST00000553948 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF34Q8IZ26 560 aa42.17■■■■■ 4.34
TTC7B-202ENST00000553948 NECTIN2Q92692 538 aa42.17■■■■■ 4.34
TTC7B-202ENST00000553948 ANXA1P04083 346 aa42.16■■■■■ 4.34
TTC7B-202ENST00000553948 ABCC12Q96J65 1359 aa42.15■■■■■ 4.34
TTC7B-202ENST00000553948 GLTPD2A6NH11 291 aa42.15■■■■■ 4.34
TTC7B-202ENST00000553948 KRT24Q2M2I5 525 aa42.15■■■■■ 4.34
TTC7B-202ENST00000553948 ERFEQ4G0M1 354 aa42.15■■■■■ 4.34
TTC7B-202ENST00000553948 C7orf43Q8WVR3 580 aa42.14■■■■■ 4.34
TTC7B-202ENST00000553948 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
TTC7B-202ENST00000553948 SUSD4Q5VX71 490 aa42.13■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 ALDH1B1P30837 517 aa42.12■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC93Q567U6 631 aa42.12■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 CFAP44Q96MT7 982 aa42.12■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 APAF1O14727 1248 aa42.11■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 CRY2Q49AN0 593 aa42.1■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 PARP10Q53GL7 1025 aa42.1■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa42.1■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP42.1■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 RIC1Q4ADV7 1423 aa42.1■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 COPS6Q7L5N1 327 aa42.09■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 CEP350Q5VT06 3117 aa42.09■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 NTSR2O95665 410 aa42.08■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 XAGE3Q8WTP9 111 aa42.08■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 HOXB7P09629 217 aa42.07■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 DPY19L2Q6NUT2 758 aa42.07■■■■■ 4.33
TTC7B-202ENST00000553948 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa42.05■■■■■ 4.32
TTC7B-202ENST00000553948 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
TTC7B-202ENST00000553948 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
TTC7B-202ENST00000553948 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
TTC7B-202ENST00000553948 MBIPQ9NS73 344 aa42.04■■■■■ 4.32
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