RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	EPHX2	P34913	555 aa		18.74	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	PDE6B	P35913	854 aa		18.74	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	SLC51A	Q86UW1	340 aa		18.74	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		18.73	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		18.73	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	HMOX1	P09601	288 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	SRGN	P10124	158 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	RGS19	P49795	217 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	HACL1	Q9UJ83	578 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		18.72	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	AOC2	O75106	756 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	IL13	P35225	146 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	PANK3	Q9H999	370 aa		18.71	■□□□□ 0.59
CS-231	ENST00000552222	TRAF5	O00463	557 aa		18.7	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	A1BG	P04217	495 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	CNBD1	Q8NA66	436 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	CNKSR1	Q969H4	720 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	CAPNS2	Q96L46	248 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		18.69	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	SCN4A	P35499	1836 aa		18.68	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	STYK1	Q6J9G0	422 aa		18.68	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	18.68	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	MRC1	P22897	1456 aa		18.68	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	NPHP1	O15259	732 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	CAMTA2	O94983	1202 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	MASTL	Q96GX5	879 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	CST9	Q5W186	159 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	COL4A5	P29400	1685 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	SCN7A	Q01118	1682 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	LTBP1	Q14766	1721 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	FAM177B	A6PVY3	158 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	KCNQ3	O43525	872 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	CCDC93	Q567U6	631 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	SETDB2	Q96T68	719 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-231	ENST00000552222	EPS15	P42566	896 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	18.64	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	MORC1	Q86VD1	984 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222		A0A087WZG4	1122 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	STARD3NL	O95772	234 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	SYNE4	Q8N205	404 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	FZD9	O00144	591 aa		18.62	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	ST5	P78524	1137 aa		18.62	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		18.62	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	ZIC5	Q96T25	663 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	SCNN1D	P51172	638 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	DGKZ	Q13574	1117 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	SOGA3	Q5TF21	947 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-231	ENST00000552222	NPR1	P16066	1061 aa		18.58	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	SOX10	P56693	466 aa		18.58	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	DLK2	Q6UY11	383 aa		18.58	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	USP16	Q9Y5T5	823 aa		18.58	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	ZNF790	Q6PG37	636 aa		18.57	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	GPC2	Q8N158	579 aa		18.57	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		18.57	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	ECE1	P42892	770 aa		18.55	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		18.55	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		18.54	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	SNED1	Q8TER0	1413 aa		18.54	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		18.53	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		18.53	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		18.53	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	HLF	Q16534	295 aa		18.52	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		18.52	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	18.52	■□□□□ 0.56
CS-231	ENST00000552222	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55

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