RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 C7orf43Q8WVR3 580 aa18.82■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 HACL1Q9UJ83 578 aa18.82■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa18.82■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 LTBP1Q14766 1721 aa18.82■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 STYK1Q6J9G0 422 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 CNKSR1Q969H4 720 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 IL13P35225 146 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 VSIG10Q8N0Z9 540 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 GRM1Q13255 1194 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 CYP4F22Q6NT55 531 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 MASTLQ96GX5 879 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 CAPNS2Q96L46 248 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 CNBD1Q8NA66 436 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 BCORQ6W2J9 1755 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-230ENST00000551968 COL4A5P29400 1685 aa18.76■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 A0A087WZG4 1122 aa18.76■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 SOGA3Q5TF21 947 aa18.76■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 CFAP44Q96MT7 982 aa18.76■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa18.75■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 AOC2O75106 756 aa18.75■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 CAMTA2O94983 1202 aa18.75■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 CCDC93Q567U6 631 aa18.75■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 MCOLN1Q9GZU1 580 aa18.75■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 FZD9O00144 591 aa18.74■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 CST9Q5W186 159 aa18.74■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 SETDB2Q96T68 719 aa18.74■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 TRPM7Q96QT4 1865 aa18.73■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 TRAF5O00463 557 aa18.73■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 STARD3NLO95772 234 aa18.73■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 A1BGP04217 495 aa18.73■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 ST5P78524 1137 aa18.73■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 HMOX1P09601 288 aa18.72■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 NPHP1O15259 732 aa18.71■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 PANK3Q9H999 370 aa18.71■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 SNED1Q8TER0 1413 aa18.71■□□□□ 0.59
CS-230ENST00000551968 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 IARSP41252 1262 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 SLC51AQ86UW1 340 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 GPC2Q8N158 579 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 BEGAINQ9BUH8 593 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 MORC1Q86VD1 984 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 SYNE4Q8N205 404 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 NPR1P16066 1061 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 EPS15P42566 896 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 ECE1P42892 770 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 TTC5Q8N0Z6 440 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 GJA3Q9Y6H8 435 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 TLL2Q9Y6L7 1015 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 SCNN1DP51172 638 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 DGKZQ13574 1117 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 ZNF790Q6PG37 636 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 KCNQ3O43525 872 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 RTKN2Q8IZC4 609 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 IL17REQ8NFR9 667 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-230ENST00000551968 MAP2K2P36507 400 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-230ENST00000551968 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-230ENST00000551968 FAM177BA6PVY3 158 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-230ENST00000551968 ZIC5Q96T25 663 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-230ENST00000551968 SAPCD2Q86UD0 394 aa18.62■□□□□ 0.57
CS-230ENST00000551968 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
CS-230ENST00000551968 USP16Q9Y5T5 823 aa18.62■□□□□ 0.57
CS-230ENST00000551968 SOX10P56693 466 aa18.61■□□□□ 0.57
CS-230ENST00000551968 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
CS-230ENST00000551968 EIF6P56537 245 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
CS-230ENST00000551968 CIAPIN1Q6FI81 312 aa18.6■□□□□ 0.57
CS-230ENST00000551968 JDP2Q8WYK2 163 aa18.6■□□□□ 0.57
CS-230ENST00000551968 PSMD1Q99460 953 aa18.6■□□□□ 0.57
CS-230ENST00000551968 CELF2O95319 508 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CS-230ENST00000551968 FMNL2Q96PY5 1086 aa18.59■□□□□ 0.57
CS-230ENST00000551968 ABCC12Q96J65 1359 aa18.58■□□□□ 0.57
CS-230ENST00000551968 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 TEFQ10587 303 aa18.58■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 CLEC4GQ6UXB4 293 aa18.58■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP18.58■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 CA12O43570 354 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 TPTE2Q6XPS3 522 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 ALDH1B1P30837 517 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 HLFQ16534 295 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms