RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 GIMAP6Q6P9H5 292 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 MIS18AQ9NYP9 233 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 GJB2P29033 226 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 RASEFQ8IZ41 740 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 PYCARDQ9ULZ3 195 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 GNAT3A8MTJ3 354 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 SURF6O75683 361 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 PDCP20941 246 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 KRT85P78386 507 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 FAM69CQ0P6D2 419 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 MAP3K11Q16584 847 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 NUTM1Q86Y26 1132 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 PDRG1Q9NUG6 133 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 UBR1Q8IWV7 1749 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 KDM3BQ7LBC6 1761 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 NWD1Q149M9 1564 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 ROBO2Q9HCK4 1378 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 AP5Z1O43299 807 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 FOXO3O43524 673 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 HOXB7P09629 217 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 CASTP20810 708 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 NUP62CLQ9H1M0 184 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 SMTNL1A8MU46 457 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 CAVIN2O95810 425 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 PIK3C2AO00443 1686 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 HIP1O00291 1037 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 MTX1Q13505 466 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 CCDC83Q8IWF9 413 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 GPATCH3Q96I76 525 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 PRDM10Q9NQV6 1147 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 LARGE1O95461 756 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 CDC25BP30305 580 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 TYRO3Q06418 890 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 ATP2B3Q16720 1220 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 EYA1Q99502 592 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 SNRKQ9NRH2 765 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 MRVI1Q9Y6F6 885 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 PSMA5P28066 241 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 ANKRD1Q15327 319 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 ERC1Q8IUD2 1116 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 MPNDQ8N594 471 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 TSC1Q92574 1164 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 ARID3AQ99856 593 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 HDAC5Q9UQL6 1122 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 NPHP3Q7Z494 1330 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 SRGAP3O43295 1099 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 CBX1P83916 185 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 NECTIN1Q15223 517 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 TTC6Q86TZ1 520 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 PLA2G4DQ86XP0 818 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 OGFRQ9NZT2 677 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 TMEM2Q9UHN6 1383 aa12.52□□□□□ -0.4
CS-202ENST00000542324 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 PLCB2Q00722 1185 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 ST3GAL1Q11201 340 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 EVI5LQ96CN4 794 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 ECHDC1Q9NTX5 307 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 NEMFO60524 1076 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 PTGS1P23219 599 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 ZNF75DP51815 510 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 TAF3Q5VWG9 929 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 TNMDQ9H2S6 317 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 CLSTN2Q9H4D0 955 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 AMPHP49418 695 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 ME3Q16798 604 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 PLPPR3Q6T4P5 718 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 SPC24Q8NBT2 197 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 CBX8Q9HC52 389 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-202ENST00000542324 SPG7Q9UQ90 795 aa12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms