RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 CREBZFQ9NS37 354 aa21.92■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 IFT57Q9NWB7 429 aa21.92■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 CNTNAP1P78357 1384 aa21.91■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 GOLGA2Q08379 1002 aa21.91■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 TEFQ10587 303 aa21.91■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.91■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 CFAP44Q96MT7 982 aa21.9■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 CHL1O00533 1208 aa21.89■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 CABP4P57796 275 aa21.89■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 GNAI1P63096 354 aa21.89■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 SLFN5Q08AF3 891 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 E9PSI1 815 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.86■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 PASKQ96RG2 1323 aa21.85■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 CHADLQ6NUI6 762 aa21.84■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.84■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 ABHD8Q96I13 439 aa21.84■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.84■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.83■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 BTBD11A6QL63 1104 aa21.83■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 MBIPQ9NS73 344 aa21.83■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.83■■□□□ 1.09
PACS1-208ENST00000529677 VEGFBP49765 207 aa21.82■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 LBX1P52954 281 aa21.82■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 NFIXQ14938 502 aa21.82■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.82■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 WBP1LQ9NX94 342 aa21.82■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.82■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.82■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.81■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 ZNF790Q6PG37 636 aa21.81■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.81■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.8■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.8■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 TTLL6Q8N841 843 aa21.79■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 KCNQ3O43525 872 aa21.77■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 SLC39A6Q13433 755 aa21.77■■□□□ 1.08
PACS1-208ENST00000529677 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.76■■□□□ 1.07
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PACS1-208ENST00000529677 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.76■■□□□ 1.07
PACS1-208ENST00000529677 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.76■■□□□ 1.07
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PACS1-208ENST00000529677 SCN4AP35499 1836 aa21.74■■□□□ 1.07
PACS1-208ENST00000529677 SERPINB2P05120 415 aa21.74■■□□□ 1.07
PACS1-208ENST00000529677 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.74■■□□□ 1.07
PACS1-208ENST00000529677 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.74■■□□□ 1.07
PACS1-208ENST00000529677 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PACS1-208ENST00000529677 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.74■■□□□ 1.07
PACS1-208ENST00000529677 CACNA1SQ13698 1873 aa21.73■■□□□ 1.07
PACS1-208ENST00000529677 HOXB7P09629 217 aa21.73■■□□□ 1.07
PACS1-208ENST00000529677 ERFEQ4G0M1 354 aa21.73■■□□□ 1.07
PACS1-208ENST00000529677 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.73■■□□□ 1.07
PACS1-208ENST00000529677 AIDAQ96BJ3 306 aa21.73■■□□□ 1.07
PACS1-208ENST00000529677 SLX4Q8IY92 1834 aa21.72■■□□□ 1.07
PACS1-208ENST00000529677 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PACS1-208ENST00000529677 NARFQ9UHQ1 456 aa21.72■■□□□ 1.07
PACS1-208ENST00000529677 COL15A1P39059 1388 aa21.72■■□□□ 1.07
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PACS1-208ENST00000529677 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.71■■□□□ 1.07
PACS1-208ENST00000529677 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.71■■□□□ 1.07
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PACS1-208ENST00000529677 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.69■■□□□ 1.06
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PACS1-208ENST00000529677 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PACS1-208ENST00000529677 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PACS1-208ENST00000529677 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.69■■□□□ 1.06
PACS1-208ENST00000529677 RASSF10A6NK89 507 aa21.68■■□□□ 1.06
PACS1-208ENST00000529677 H0YIN7 160 aa21.68■■□□□ 1.06
PACS1-208ENST00000529677 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PACS1-208ENST00000529677 TSPYL6Q8N831 410 aa21.68■■□□□ 1.06
PACS1-208ENST00000529677 SCN7AQ01118 1682 aa21.68■■□□□ 1.06
PACS1-208ENST00000529677 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PACS1-208ENST00000529677 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PACS1-208ENST00000529677 VAMP4O75379 141 aa21.66■■□□□ 1.06
PACS1-208ENST00000529677 ZNF428Q96B54 188 aa21.66■■□□□ 1.06
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