RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527118.5

RBBP4-218, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 3

Gene RBBP4, Length 700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-218ENST00000527118 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.55■□□□□ 0.88
RBBP4-218ENST00000527118 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.883e-23■□□□□ 8.3
RBBP4-218ENST00000527118 RNF181Q9P0P0 153 aa20.55■□□□□ 0.88
RBBP4-218ENST00000527118 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.55■□□□□ 0.88
RBBP4-218ENST00000527118 ST5P78524 1137 aa20.54■□□□□ 0.88
RBBP4-218ENST00000527118 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
RBBP4-218ENST00000527118 NEUROD2Q15784 382 aa20.54■□□□□ 0.88
RBBP4-218ENST00000527118 SLX4Q8IY92 1834 aa20.54■□□□□ 0.88
RBBP4-218ENST00000527118 KIF3CO14782 793 aa20.53■□□□□ 0.88
RBBP4-218ENST00000527118 HLFQ16534 295 aa20.53■□□□□ 0.88
RBBP4-218ENST00000527118 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RBBP4-218ENST00000527118 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RBBP4-218ENST00000527118 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.53■□□□□ 0.88
RBBP4-218ENST00000527118 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.53■□□□□ 0.88
RBBP4-218ENST00000527118 MYL6BP14649 208 aa20.52■□□□□ 0.88
RBBP4-218ENST00000527118 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.52■□□□□ 0.88
RBBP4-218ENST00000527118 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RBBP4-218ENST00000527118 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
RBBP4-218ENST00000527118 FAM177BA6PVY3 158 aa20.51■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 RUNDC1Q96C34 613 aa20.51■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.51■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.51■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.5■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 PRELPP51888 382 aa20.49■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.49■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 RGL2O15211 777 aa20.48■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 C21orf2O43822 256 aa20.48■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 SRGNP10124 158 aa20.48■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.48■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.48■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 NFKBIEO00221 500 aa20.47■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.47■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.47■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.46■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 LMNB1P20700 586 aa20.46■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 STYK1Q6J9G0 422 aa20.46■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 CNKSR1Q969H4 720 aa20.46■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 MASTLQ96GX5 879 aa20.46■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.46■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.46■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RBBP4-218ENST00000527118 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 ERBB4Q15303 1308 aa20.45■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 ANXA1P04083 346 aa20.44■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 NECTIN2Q92692 538 aa20.44■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.44■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.44■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 GPTP24298 496 aa20.43■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 KRT24Q2M2I5 525 aa20.43■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 PROSER3Q2NL68 480 aa20.43■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.43■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 CHL1O00533 1208 aa20.42■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 TOMM70O94826 608 aa20.42■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 PDIA6Q15084 440 aa20.42■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.42■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 ABCC12Q96J65 1359 aa20.42■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 NPR1P16066 1061 aa20.41■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 HSPA6P17066 643 aa20.41■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.41■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 RRAGCQ9HB90 399 aa20.41■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 CEP350Q5VT06 3117 aa20.4■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 ERFEQ4G0M1 354 aa20.4■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 NYXQ9GZU5 481 aa20.4■□□□□ 0.86
RBBP4-218ENST00000527118 SUSD4Q5VX71 490 aa20.39■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.39■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 APAF1O14727 1248 aa20.38■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.38■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.37■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 GLTPD2A6NH11 291 aa20.37■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 SOGA3Q5TF21 947 aa20.37■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 OLFM4Q6UX06 510 aa20.37■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.37■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 LAMB2P55268 1798 aa20.36■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 CCDC184Q52MB2 194 aa20.36■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 COPS6Q7L5N1 327 aa20.36■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.36■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 NTSR2O95665 410 aa20.35■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 CCDC93Q567U6 631 aa20.35■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 CFAP44Q96MT7 982 aa20.35■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.35■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 WDR90Q96KV7 1748 aa20.35■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 ALDH1B1P30837 517 aa20.34■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 CRY2Q49AN0 593 aa20.34■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 MBIPQ9NS73 344 aa20.34■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.33■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.33■□□□□ 0.85
RBBP4-218ENST00000527118 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
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