RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512343.5

RASGEF1B-209, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RASGEF1B, Length 498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-209ENST00000512343 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
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RASGEF1B-209ENST00000512343 MIS18AQ9NYP9 233 aa29.31■■■□□ 2.28
RASGEF1B-209ENST00000512343 NBPF26B4DH59 902 aa29.3■■■□□ 2.28
RASGEF1B-209ENST00000512343 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
RASGEF1B-209ENST00000512343 NBPF15Q8N660 670 aa29.3■■■□□ 2.28
RASGEF1B-209ENST00000512343 ST5P78524 1137 aa29.29■■■□□ 2.28
RASGEF1B-209ENST00000512343 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.29■■■□□ 2.28
RASGEF1B-209ENST00000512343 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa29.28■■■□□ 2.28
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RASGEF1B-209ENST00000512343 SMC1BQ8NDV3 1235 aa29.27■■■□□ 2.28
RASGEF1B-209ENST00000512343 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
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RASGEF1B-209ENST00000512343 STYK1Q6J9G0 422 aa29.25■■■□□ 2.27
RASGEF1B-209ENST00000512343 FAM177BA6PVY3 158 aa29.24■■■□□ 2.27
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RASGEF1B-209ENST00000512343 CLEC4GQ6UXB4 293 aa29.24■■■□□ 2.27
RASGEF1B-209ENST00000512343 CNKSR1Q969H4 720 aa29.24■■■□□ 2.27
RASGEF1B-209ENST00000512343 KLRG1Q96E93 195 aa29.23■■■□□ 2.27
RASGEF1B-209ENST00000512343 MASTLQ96GX5 879 aa29.23■■■□□ 2.27
RASGEF1B-209ENST00000512343 KDM3BQ7LBC6 1761 aa29.23■■■□□ 2.27
RASGEF1B-209ENST00000512343 TAOK3Q9H2K8 898 aa29.22■■■□□ 2.27
RASGEF1B-209ENST00000512343 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29.22■■■□□ 2.27
RASGEF1B-209ENST00000512343 ZNF652Q9Y2D9 606 aa29.22■■■□□ 2.27
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RASGEF1B-209ENST00000512343 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
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RASGEF1B-209ENST00000512343 LTBP3Q9NS15 1303 aa29.19■■■□□ 2.26
RASGEF1B-209ENST00000512343 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.18■■■□□ 2.26
RASGEF1B-209ENST00000512343 NUP98P52948 1817 aa29.16■■■□□ 2.26
RASGEF1B-209ENST00000512343 NEFMP07197 916 aa29.16■■■□□ 2.26
RASGEF1B-209ENST00000512343 OLFM4Q6UX06 510 aa29.16■■■□□ 2.26
RASGEF1B-209ENST00000512343 TPTE2Q6XPS3 522 aa29.16■■■□□ 2.26
RASGEF1B-209ENST00000512343 DDNO94850 711 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
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RASGEF1B-209ENST00000512343 NPR1P16066 1061 aa29.14■■■□□ 2.26
RASGEF1B-209ENST00000512343 JMYQ8N9B5 988 aa29.14■■■□□ 2.26
RASGEF1B-209ENST00000512343 NFE2L2Q16236 605 aa29.13■■■□□ 2.25
RASGEF1B-209ENST00000512343 SOGA3Q5TF21 947 aa29.13■■■□□ 2.25
RASGEF1B-209ENST00000512343 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
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RASGEF1B-209ENST00000512343 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
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RASGEF1B-209ENST00000512343 CCDC93Q567U6 631 aa29.11■■■□□ 2.25
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RASGEF1B-209ENST00000512343 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
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RASGEF1B-209ENST00000512343 NTSR2O95665 410 aa28.94■■■□□ 2.22
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RASGEF1B-209ENST00000512343 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
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